Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC28

Csnk1d, Casein kinase I isoform delta, mousemouse

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1dQ9DC28 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Csnk1dQ9DC28 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Csnk1dQ9DC28 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Csnk1dQ9DC28 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Csnk1dQ9DC28 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Csnk1dQ9DC28 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Csnk1dQ9DC28 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Csnk1dQ9DC28 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Csnk1dQ9DC28 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Csnk1dQ9DC28 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Csnk1dQ9DC28 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Csnk1dQ9DC28 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Csnk1dQ9DC28 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Csnk1dQ9DC28 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Csnk1dQ9DC28 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Csnk1dQ9DC28 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Csnk1dQ9DC28 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Csnk1dQ9DC28 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Csnk1dQ9DC28 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Csnk1dQ9DC28 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Csnk1dQ9DC28 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Csnk1dQ9DC28 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Csnk1dQ9DC28 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Csnk1dQ9DC28 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Csnk1dQ9DC28 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Csnk1dQ9DC28 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Csnk1dQ9DC28 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Csnk1dQ9DC28 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Csnk1dQ9DC28 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Csnk1dQ9DC28 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Csnk1dQ9DC28 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Csnk1dQ9DC28 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Csnk1dQ9DC28 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Csnk1dQ9DC28 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Csnk1dQ9DC28 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Csnk1dQ9DC28 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Csnk1dQ9DC28 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Csnk1dQ9DC28 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Csnk1dQ9DC28 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Csnk1dQ9DC28 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Csnk1dQ9DC28 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Csnk1dQ9DC28 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Csnk1dQ9DC28 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Csnk1dQ9DC28 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Csnk1dQ9DC28 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Csnk1dQ9DC28 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Csnk1dQ9DC28 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Csnk1dQ9DC28 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Csnk1dQ9DC28 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Csnk1dQ9DC28 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Csnk1dQ9DC28 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Csnk1dQ9DC28 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Csnk1dQ9DC28 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Csnk1dQ9DC28 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Csnk1dQ9DC28 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Csnk1dQ9DC28 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Csnk1dQ9DC28 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Csnk1dQ9DC28 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Csnk1dQ9DC28 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Csnk1dQ9DC28 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Csnk1dQ9DC28 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Csnk1dQ9DC28 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Csnk1dQ9DC28 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Csnk1dQ9DC28 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Csnk1dQ9DC28 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Csnk1dQ9DC28 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Csnk1dQ9DC28 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Csnk1dQ9DC28 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Csnk1dQ9DC28 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Csnk1dQ9DC28 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Csnk1dQ9DC28 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Csnk1dQ9DC28 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Csnk1dQ9DC28 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Csnk1dQ9DC28 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Csnk1dQ9DC28 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Csnk1dQ9DC28 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Csnk1dQ9DC28 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Csnk1dQ9DC28 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Csnk1dQ9DC28 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Csnk1dQ9DC28 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Csnk1dQ9DC28 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Csnk1dQ9DC28 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Csnk1dQ9DC28 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Csnk1dQ9DC28 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Csnk1dQ9DC28 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Csnk1dQ9DC28 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Csnk1dQ9DC28 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Csnk1dQ9DC28 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Csnk1dQ9DC28 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Csnk1dQ9DC28 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Csnk1dQ9DC28 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Csnk1dQ9DC28 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Csnk1dQ9DC28 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Csnk1dQ9DC28 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Csnk1dQ9DC28 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Csnk1dQ9DC28 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Csnk1dQ9DC28 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Csnk1dQ9DC28 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Csnk1dQ9DC28 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Csnk1dQ9DC28 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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