Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG1

Cyp27a1, Sterol 26-hydroxylase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp27a1Q9DBG1 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cyp27a1Q9DBG1 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cyp27a1Q9DBG1 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cyp27a1Q9DBG1 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cyp27a1Q9DBG1 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cyp27a1Q9DBG1 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cyp27a1Q9DBG1 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cyp27a1Q9DBG1 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cyp27a1Q9DBG1 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cyp27a1Q9DBG1 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cyp27a1Q9DBG1 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cyp27a1Q9DBG1 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cyp27a1Q9DBG1 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cyp27a1Q9DBG1 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cyp27a1Q9DBG1 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cyp27a1Q9DBG1 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cyp27a1Q9DBG1 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cyp27a1Q9DBG1 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cyp27a1Q9DBG1 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cyp27a1Q9DBG1 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cyp27a1Q9DBG1 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cyp27a1Q9DBG1 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cyp27a1Q9DBG1 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cyp27a1Q9DBG1 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cyp27a1Q9DBG1 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cyp27a1Q9DBG1 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cyp27a1Q9DBG1 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cyp27a1Q9DBG1 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cyp27a1Q9DBG1 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cyp27a1Q9DBG1 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cyp27a1Q9DBG1 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cyp27a1Q9DBG1 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cyp27a1Q9DBG1 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cyp27a1Q9DBG1 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cyp27a1Q9DBG1 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cyp27a1Q9DBG1 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cyp27a1Q9DBG1 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cyp27a1Q9DBG1 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cyp27a1Q9DBG1 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cyp27a1Q9DBG1 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cyp27a1Q9DBG1 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cyp27a1Q9DBG1 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cyp27a1Q9DBG1 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cyp27a1Q9DBG1 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cyp27a1Q9DBG1 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cyp27a1Q9DBG1 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cyp27a1Q9DBG1 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cyp27a1Q9DBG1 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cyp27a1Q9DBG1 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cyp27a1Q9DBG1 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cyp27a1Q9DBG1 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cyp27a1Q9DBG1 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cyp27a1Q9DBG1 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cyp27a1Q9DBG1 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cyp27a1Q9DBG1 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cyp27a1Q9DBG1 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cyp27a1Q9DBG1 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cyp27a1Q9DBG1 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cyp27a1Q9DBG1 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cyp27a1Q9DBG1 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cyp27a1Q9DBG1 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cyp27a1Q9DBG1 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cyp27a1Q9DBG1 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyp27a1Q9DBG1 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyp27a1Q9DBG1 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyp27a1Q9DBG1 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyp27a1Q9DBG1 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyp27a1Q9DBG1 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyp27a1Q9DBG1 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyp27a1Q9DBG1 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyp27a1Q9DBG1 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyp27a1Q9DBG1 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyp27a1Q9DBG1 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyp27a1Q9DBG1 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyp27a1Q9DBG1 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyp27a1Q9DBG1 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyp27a1Q9DBG1 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyp27a1Q9DBG1 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyp27a1Q9DBG1 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyp27a1Q9DBG1 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyp27a1Q9DBG1 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyp27a1Q9DBG1 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyp27a1Q9DBG1 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyp27a1Q9DBG1 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyp27a1Q9DBG1 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyp27a1Q9DBG1 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cyp27a1Q9DBG1 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cyp27a1Q9DBG1 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cyp27a1Q9DBG1 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cyp27a1Q9DBG1 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cyp27a1Q9DBG1 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cyp27a1Q9DBG1 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cyp27a1Q9DBG1 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cyp27a1Q9DBG1 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cyp27a1Q9DBG1 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cyp27a1Q9DBG1 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cyp27a1Q9DBG1 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cyp27a1Q9DBG1 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cyp27a1Q9DBG1 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cyp27a1Q9DBG1 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms