Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB16

Cab39l, Calcium-binding protein 39-like, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39lQ9DB16 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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