Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAU1

Cnpy3, Protein canopy homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnpy3Q9DAU1 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnpy3Q9DAU1 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnpy3Q9DAU1 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnpy3Q9DAU1 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnpy3Q9DAU1 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnpy3Q9DAU1 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnpy3Q9DAU1 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnpy3Q9DAU1 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnpy3Q9DAU1 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnpy3Q9DAU1 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnpy3Q9DAU1 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnpy3Q9DAU1 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnpy3Q9DAU1 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnpy3Q9DAU1 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnpy3Q9DAU1 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnpy3Q9DAU1 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnpy3Q9DAU1 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnpy3Q9DAU1 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.02
Cnpy3Q9DAU1 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnpy3Q9DAU1 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnpy3Q9DAU1 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnpy3Q9DAU1 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnpy3Q9DAU1 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnpy3Q9DAU1 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnpy3Q9DAU1 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnpy3Q9DAU1 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnpy3Q9DAU1 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnpy3Q9DAU1 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnpy3Q9DAU1 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnpy3Q9DAU1 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnpy3Q9DAU1 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnpy3Q9DAU1 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnpy3Q9DAU1 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnpy3Q9DAU1 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnpy3Q9DAU1 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnpy3Q9DAU1 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnpy3Q9DAU1 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnpy3Q9DAU1 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnpy3Q9DAU1 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnpy3Q9DAU1 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnpy3Q9DAU1 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnpy3Q9DAU1 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnpy3Q9DAU1 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnpy3Q9DAU1 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnpy3Q9DAU1 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnpy3Q9DAU1 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnpy3Q9DAU1 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnpy3Q9DAU1 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnpy3Q9DAU1 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnpy3Q9DAU1 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnpy3Q9DAU1 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnpy3Q9DAU1 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnpy3Q9DAU1 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnpy3Q9DAU1 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnpy3Q9DAU1 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnpy3Q9DAU1 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnpy3Q9DAU1 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnpy3Q9DAU1 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnpy3Q9DAU1 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnpy3Q9DAU1 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnpy3Q9DAU1 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnpy3Q9DAU1 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnpy3Q9DAU1 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnpy3Q9DAU1 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnpy3Q9DAU1 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnpy3Q9DAU1 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnpy3Q9DAU1 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnpy3Q9DAU1 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnpy3Q9DAU1 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnpy3Q9DAU1 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnpy3Q9DAU1 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnpy3Q9DAU1 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnpy3Q9DAU1 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnpy3Q9DAU1 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnpy3Q9DAU1 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnpy3Q9DAU1 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnpy3Q9DAU1 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnpy3Q9DAU1 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnpy3Q9DAU1 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnpy3Q9DAU1 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnpy3Q9DAU1 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnpy3Q9DAU1 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnpy3Q9DAU1 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnpy3Q9DAU1 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnpy3Q9DAU1 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnpy3Q9DAU1 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnpy3Q9DAU1 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnpy3Q9DAU1 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnpy3Q9DAU1 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnpy3Q9DAU1 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnpy3Q9DAU1 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnpy3Q9DAU1 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnpy3Q9DAU1 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnpy3Q9DAU1 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnpy3Q9DAU1 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnpy3Q9DAU1 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnpy3Q9DAU1 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnpy3Q9DAU1 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnpy3Q9DAU1 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnpy3Q9DAU1 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms