Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M9

Rnf138rt1, RIKEN cDNA 1700045I19, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf138rt1Q9D9M9 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnf138rt1Q9D9M9 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnf138rt1Q9D9M9 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnf138rt1Q9D9M9 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnf138rt1Q9D9M9 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnf138rt1Q9D9M9 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnf138rt1Q9D9M9 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnf138rt1Q9D9M9 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnf138rt1Q9D9M9 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnf138rt1Q9D9M9 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnf138rt1Q9D9M9 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnf138rt1Q9D9M9 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnf138rt1Q9D9M9 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnf138rt1Q9D9M9 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnf138rt1Q9D9M9 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnf138rt1Q9D9M9 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnf138rt1Q9D9M9 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnf138rt1Q9D9M9 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnf138rt1Q9D9M9 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnf138rt1Q9D9M9 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnf138rt1Q9D9M9 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnf138rt1Q9D9M9 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnf138rt1Q9D9M9 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnf138rt1Q9D9M9 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnf138rt1Q9D9M9 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnf138rt1Q9D9M9 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnf138rt1Q9D9M9 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnf138rt1Q9D9M9 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnf138rt1Q9D9M9 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rnf138rt1Q9D9M9 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rnf138rt1Q9D9M9 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rnf138rt1Q9D9M9 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rnf138rt1Q9D9M9 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Rnf138rt1Q9D9M9 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rnf138rt1Q9D9M9 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rnf138rt1Q9D9M9 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Rnf138rt1Q9D9M9 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Rnf138rt1Q9D9M9 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Rnf138rt1Q9D9M9 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Rnf138rt1Q9D9M9 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rnf138rt1Q9D9M9 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Rnf138rt1Q9D9M9 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rnf138rt1Q9D9M9 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Rnf138rt1Q9D9M9 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rnf138rt1Q9D9M9 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rnf138rt1Q9D9M9 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rnf138rt1Q9D9M9 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rnf138rt1Q9D9M9 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rnf138rt1Q9D9M9 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms