Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U8

Snx5, Sorting nexin-5, mousemouse

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Length 404 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx5Q9D8U8 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Snx5Q9D8U8 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Snx5Q9D8U8 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Snx5Q9D8U8 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Snx5Q9D8U8 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Snx5Q9D8U8 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Snx5Q9D8U8 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Snx5Q9D8U8 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Snx5Q9D8U8 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Snx5Q9D8U8 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Snx5Q9D8U8 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Snx5Q9D8U8 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Snx5Q9D8U8 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Snx5Q9D8U8 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Snx5Q9D8U8 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Snx5Q9D8U8 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Snx5Q9D8U8 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Snx5Q9D8U8 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Snx5Q9D8U8 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Snx5Q9D8U8 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Snx5Q9D8U8 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Snx5Q9D8U8 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Snx5Q9D8U8 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Snx5Q9D8U8 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Snx5Q9D8U8 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Snx5Q9D8U8 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Snx5Q9D8U8 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Snx5Q9D8U8 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Snx5Q9D8U8 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Snx5Q9D8U8 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Snx5Q9D8U8 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Snx5Q9D8U8 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Snx5Q9D8U8 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Snx5Q9D8U8 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Snx5Q9D8U8 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Snx5Q9D8U8 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Snx5Q9D8U8 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Snx5Q9D8U8 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Snx5Q9D8U8 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Snx5Q9D8U8 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Snx5Q9D8U8 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Snx5Q9D8U8 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Snx5Q9D8U8 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Snx5Q9D8U8 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Snx5Q9D8U8 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Snx5Q9D8U8 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Snx5Q9D8U8 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Snx5Q9D8U8 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Snx5Q9D8U8 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Snx5Q9D8U8 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Snx5Q9D8U8 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Snx5Q9D8U8 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Snx5Q9D8U8 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Snx5Q9D8U8 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Snx5Q9D8U8 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Snx5Q9D8U8 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
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Snx5Q9D8U8 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Snx5Q9D8U8 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Snx5Q9D8U8 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Snx5Q9D8U8 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Snx5Q9D8U8 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Snx5Q9D8U8 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Snx5Q9D8U8 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Snx5Q9D8U8 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Snx5Q9D8U8 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Snx5Q9D8U8 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Snx5Q9D8U8 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
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Snx5Q9D8U8 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Snx5Q9D8U8 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Snx5Q9D8U8 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Snx5Q9D8U8 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Snx5Q9D8U8 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Snx5Q9D8U8 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Snx5Q9D8U8 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Snx5Q9D8U8 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Snx5Q9D8U8 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Snx5Q9D8U8 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Snx5Q9D8U8 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Snx5Q9D8U8 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Snx5Q9D8U8 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Snx5Q9D8U8 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Snx5Q9D8U8 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Snx5Q9D8U8 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Snx5Q9D8U8 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Snx5Q9D8U8 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Snx5Q9D8U8 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Snx5Q9D8U8 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Snx5Q9D8U8 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Snx5Q9D8U8 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Snx5Q9D8U8 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Snx5Q9D8U8 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Snx5Q9D8U8 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Snx5Q9D8U8 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Snx5Q9D8U8 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Snx5Q9D8U8 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Snx5Q9D8U8 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Snx5Q9D8U8 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
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