Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7D7

Cldn23, Claudin-23, mousemouse

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Length 296 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn23Q9D7D7 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cldn23Q9D7D7 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cldn23Q9D7D7 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cldn23Q9D7D7 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cldn23Q9D7D7 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
Cldn23Q9D7D7 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cldn23Q9D7D7 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cldn23Q9D7D7 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cldn23Q9D7D7 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cldn23Q9D7D7 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cldn23Q9D7D7 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cldn23Q9D7D7 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cldn23Q9D7D7 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn23Q9D7D7 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn23Q9D7D7 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn23Q9D7D7 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn23Q9D7D7 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn23Q9D7D7 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn23Q9D7D7 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn23Q9D7D7 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn23Q9D7D7 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn23Q9D7D7 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn23Q9D7D7 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn23Q9D7D7 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn23Q9D7D7 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn23Q9D7D7 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn23Q9D7D7 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn23Q9D7D7 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn23Q9D7D7 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn23Q9D7D7 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn23Q9D7D7 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Cldn23Q9D7D7 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn23Q9D7D7 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn23Q9D7D7 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn23Q9D7D7 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn23Q9D7D7 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn23Q9D7D7 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn23Q9D7D7 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn23Q9D7D7 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn23Q9D7D7 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn23Q9D7D7 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn23Q9D7D7 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn23Q9D7D7 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn23Q9D7D7 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn23Q9D7D7 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn23Q9D7D7 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn23Q9D7D7 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn23Q9D7D7 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn23Q9D7D7 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn23Q9D7D7 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn23Q9D7D7 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn23Q9D7D7 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn23Q9D7D7 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn23Q9D7D7 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn23Q9D7D7 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn23Q9D7D7 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn23Q9D7D7 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn23Q9D7D7 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn23Q9D7D7 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.1 ms