Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6E4

Ttc9b, Tetratricopeptide repeat protein 9B, mousemouse

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Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9bQ9D6E4 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ttc9bQ9D6E4 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ttc9bQ9D6E4 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ttc9bQ9D6E4 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ttc9bQ9D6E4 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ttc9bQ9D6E4 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ttc9bQ9D6E4 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ttc9bQ9D6E4 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ttc9bQ9D6E4 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ttc9bQ9D6E4 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ttc9bQ9D6E4 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Ttc9bQ9D6E4 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttc9bQ9D6E4 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttc9bQ9D6E4 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Ttc9bQ9D6E4 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttc9bQ9D6E4 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttc9bQ9D6E4 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttc9bQ9D6E4 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttc9bQ9D6E4 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Ttc9bQ9D6E4 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttc9bQ9D6E4 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Ttc9bQ9D6E4 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Ttc9bQ9D6E4 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ttc9bQ9D6E4 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ttc9bQ9D6E4 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ttc9bQ9D6E4 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Ttc9bQ9D6E4 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ttc9bQ9D6E4 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ttc9bQ9D6E4 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttc9bQ9D6E4 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Ttc9bQ9D6E4 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttc9bQ9D6E4 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttc9bQ9D6E4 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttc9bQ9D6E4 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttc9bQ9D6E4 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttc9bQ9D6E4 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttc9bQ9D6E4 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttc9bQ9D6E4 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttc9bQ9D6E4 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttc9bQ9D6E4 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttc9bQ9D6E4 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttc9bQ9D6E4 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttc9bQ9D6E4 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttc9bQ9D6E4 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttc9bQ9D6E4 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttc9bQ9D6E4 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
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Ttc9bQ9D6E4 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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