Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H7

Lonrf3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf3Q9D4H7 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms