Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H2

Gcc1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcc1Q9D4H2 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gcc1Q9D4H2 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gcc1Q9D4H2 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gcc1Q9D4H2 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gcc1Q9D4H2 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gcc1Q9D4H2 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gcc1Q9D4H2 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gcc1Q9D4H2 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gcc1Q9D4H2 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gcc1Q9D4H2 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gcc1Q9D4H2 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gcc1Q9D4H2 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gcc1Q9D4H2 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gcc1Q9D4H2 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gcc1Q9D4H2 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gcc1Q9D4H2 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gcc1Q9D4H2 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gcc1Q9D4H2 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gcc1Q9D4H2 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gcc1Q9D4H2 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gcc1Q9D4H2 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gcc1Q9D4H2 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gcc1Q9D4H2 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gcc1Q9D4H2 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gcc1Q9D4H2 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gcc1Q9D4H2 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gcc1Q9D4H2 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gcc1Q9D4H2 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gcc1Q9D4H2 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gcc1Q9D4H2 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gcc1Q9D4H2 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gcc1Q9D4H2 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gcc1Q9D4H2 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gcc1Q9D4H2 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gcc1Q9D4H2 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gcc1Q9D4H2 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gcc1Q9D4H2 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gcc1Q9D4H2 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gcc1Q9D4H2 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gcc1Q9D4H2 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gcc1Q9D4H2 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gcc1Q9D4H2 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gcc1Q9D4H2 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gcc1Q9D4H2 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gcc1Q9D4H2 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gcc1Q9D4H2 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gcc1Q9D4H2 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gcc1Q9D4H2 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gcc1Q9D4H2 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gcc1Q9D4H2 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gcc1Q9D4H2 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gcc1Q9D4H2 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gcc1Q9D4H2 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gcc1Q9D4H2 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gcc1Q9D4H2 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gcc1Q9D4H2 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gcc1Q9D4H2 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gcc1Q9D4H2 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gcc1Q9D4H2 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gcc1Q9D4H2 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gcc1Q9D4H2 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gcc1Q9D4H2 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gcc1Q9D4H2 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gcc1Q9D4H2 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gcc1Q9D4H2 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gcc1Q9D4H2 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gcc1Q9D4H2 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gcc1Q9D4H2 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gcc1Q9D4H2 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gcc1Q9D4H2 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gcc1Q9D4H2 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gcc1Q9D4H2 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gcc1Q9D4H2 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gcc1Q9D4H2 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gcc1Q9D4H2 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gcc1Q9D4H2 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gcc1Q9D4H2 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gcc1Q9D4H2 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gcc1Q9D4H2 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gcc1Q9D4H2 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gcc1Q9D4H2 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gcc1Q9D4H2 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gcc1Q9D4H2 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gcc1Q9D4H2 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gcc1Q9D4H2 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gcc1Q9D4H2 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gcc1Q9D4H2 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gcc1Q9D4H2 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gcc1Q9D4H2 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gcc1Q9D4H2 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gcc1Q9D4H2 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gcc1Q9D4H2 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gcc1Q9D4H2 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gcc1Q9D4H2 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gcc1Q9D4H2 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gcc1Q9D4H2 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gcc1Q9D4H2 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gcc1Q9D4H2 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gcc1Q9D4H2 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gcc1Q9D4H2 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms