Protein–RNA interactions for Protein: Q9D384

Snrnp35, U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 35 kDa protein, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrnp35Q9D384 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snrnp35Q9D384 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snrnp35Q9D384 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snrnp35Q9D384 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snrnp35Q9D384 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snrnp35Q9D384 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snrnp35Q9D384 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snrnp35Q9D384 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snrnp35Q9D384 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snrnp35Q9D384 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snrnp35Q9D384 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snrnp35Q9D384 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Snrnp35Q9D384 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snrnp35Q9D384 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snrnp35Q9D384 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snrnp35Q9D384 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snrnp35Q9D384 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snrnp35Q9D384 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snrnp35Q9D384 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snrnp35Q9D384 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snrnp35Q9D384 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Snrnp35Q9D384 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snrnp35Q9D384 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Snrnp35Q9D384 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snrnp35Q9D384 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snrnp35Q9D384 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snrnp35Q9D384 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Snrnp35Q9D384 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snrnp35Q9D384 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snrnp35Q9D384 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snrnp35Q9D384 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snrnp35Q9D384 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snrnp35Q9D384 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snrnp35Q9D384 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snrnp35Q9D384 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Snrnp35Q9D384 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Snrnp35Q9D384 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Snrnp35Q9D384 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snrnp35Q9D384 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snrnp35Q9D384 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snrnp35Q9D384 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Snrnp35Q9D384 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snrnp35Q9D384 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Snrnp35Q9D384 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Snrnp35Q9D384 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snrnp35Q9D384 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snrnp35Q9D384 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snrnp35Q9D384 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snrnp35Q9D384 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snrnp35Q9D384 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snrnp35Q9D384 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snrnp35Q9D384 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snrnp35Q9D384 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snrnp35Q9D384 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snrnp35Q9D384 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snrnp35Q9D384 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snrnp35Q9D384 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snrnp35Q9D384 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snrnp35Q9D384 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snrnp35Q9D384 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snrnp35Q9D384 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snrnp35Q9D384 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snrnp35Q9D384 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snrnp35Q9D384 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snrnp35Q9D384 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snrnp35Q9D384 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snrnp35Q9D384 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snrnp35Q9D384 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snrnp35Q9D384 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snrnp35Q9D384 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Snrnp35Q9D384 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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