Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms