Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ28

Snf8, Vacuolar-sorting protein SNF8, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snf8Q9CZ28 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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