Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY94

Gins3, DNA replication complex GINS protein PSF3, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins3Q9CY94 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gins3Q9CY94 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gins3Q9CY94 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gins3Q9CY94 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gins3Q9CY94 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gins3Q9CY94 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gins3Q9CY94 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gins3Q9CY94 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gins3Q9CY94 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gins3Q9CY94 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gins3Q9CY94 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gins3Q9CY94 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Gins3Q9CY94 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gins3Q9CY94 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gins3Q9CY94 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gins3Q9CY94 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gins3Q9CY94 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gins3Q9CY94 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gins3Q9CY94 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gins3Q9CY94 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gins3Q9CY94 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gins3Q9CY94 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gins3Q9CY94 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gins3Q9CY94 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gins3Q9CY94 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gins3Q9CY94 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gins3Q9CY94 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gins3Q9CY94 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gins3Q9CY94 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Gins3Q9CY94 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gins3Q9CY94 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gins3Q9CY94 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gins3Q9CY94 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Gins3Q9CY94 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gins3Q9CY94 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Gins3Q9CY94 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Gins3Q9CY94 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gins3Q9CY94 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Gins3Q9CY94 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gins3Q9CY94 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gins3Q9CY94 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gins3Q9CY94 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gins3Q9CY94 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gins3Q9CY94 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gins3Q9CY94 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gins3Q9CY94 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gins3Q9CY94 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gins3Q9CY94 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gins3Q9CY94 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gins3Q9CY94 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gins3Q9CY94 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gins3Q9CY94 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gins3Q9CY94 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gins3Q9CY94 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gins3Q9CY94 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gins3Q9CY94 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gins3Q9CY94 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gins3Q9CY94 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gins3Q9CY94 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gins3Q9CY94 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gins3Q9CY94 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gins3Q9CY94 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gins3Q9CY94 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gins3Q9CY94 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gins3Q9CY94 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gins3Q9CY94 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gins3Q9CY94 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gins3Q9CY94 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gins3Q9CY94 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gins3Q9CY94 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gins3Q9CY94 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gins3Q9CY94 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gins3Q9CY94 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gins3Q9CY94 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gins3Q9CY94 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gins3Q9CY94 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gins3Q9CY94 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gins3Q9CY94 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gins3Q9CY94 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gins3Q9CY94 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gins3Q9CY94 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gins3Q9CY94 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gins3Q9CY94 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gins3Q9CY94 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gins3Q9CY94 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gins3Q9CY94 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gins3Q9CY94 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gins3Q9CY94 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gins3Q9CY94 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gins3Q9CY94 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gins3Q9CY94 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gins3Q9CY94 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gins3Q9CY94 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gins3Q9CY94 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gins3Q9CY94 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gins3Q9CY94 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gins3Q9CY94 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gins3Q9CY94 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gins3Q9CY94 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gins3Q9CY94 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms