Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sgo1Q9CXH7 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sgo1Q9CXH7 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sgo1Q9CXH7 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sgo1Q9CXH7 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sgo1Q9CXH7 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Sgo1Q9CXH7 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sgo1Q9CXH7 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sgo1Q9CXH7 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sgo1Q9CXH7 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Sgo1Q9CXH7 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sgo1Q9CXH7 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sgo1Q9CXH7 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sgo1Q9CXH7 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sgo1Q9CXH7 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sgo1Q9CXH7 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sgo1Q9CXH7 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sgo1Q9CXH7 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sgo1Q9CXH7 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sgo1Q9CXH7 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sgo1Q9CXH7 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sgo1Q9CXH7 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sgo1Q9CXH7 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sgo1Q9CXH7 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sgo1Q9CXH7 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sgo1Q9CXH7 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sgo1Q9CXH7 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sgo1Q9CXH7 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Sgo1Q9CXH7 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Sgo1Q9CXH7 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sgo1Q9CXH7 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sgo1Q9CXH7 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sgo1Q9CXH7 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sgo1Q9CXH7 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sgo1Q9CXH7 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Sgo1Q9CXH7 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sgo1Q9CXH7 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sgo1Q9CXH7 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sgo1Q9CXH7 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sgo1Q9CXH7 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sgo1Q9CXH7 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sgo1Q9CXH7 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sgo1Q9CXH7 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sgo1Q9CXH7 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sgo1Q9CXH7 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sgo1Q9CXH7 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sgo1Q9CXH7 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sgo1Q9CXH7 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Sgo1Q9CXH7 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Sgo1Q9CXH7 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sgo1Q9CXH7 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sgo1Q9CXH7 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sgo1Q9CXH7 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Sgo1Q9CXH7 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sgo1Q9CXH7 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sgo1Q9CXH7 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Sgo1Q9CXH7 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sgo1Q9CXH7 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sgo1Q9CXH7 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sgo1Q9CXH7 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sgo1Q9CXH7 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sgo1Q9CXH7 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sgo1Q9CXH7 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Sgo1Q9CXH7 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Sgo1Q9CXH7 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Sgo1Q9CXH7 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sgo1Q9CXH7 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sgo1Q9CXH7 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sgo1Q9CXH7 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sgo1Q9CXH7 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sgo1Q9CXH7 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sgo1Q9CXH7 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sgo1Q9CXH7 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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