Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE6

Xrcc3, DNA repair protein XRCC3, mousemouse

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Length 349 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc3Q9CXE6 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Xrcc3Q9CXE6 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
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