Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX4

Rpusd4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase Rpusd4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd4Q9CWX4 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Rpusd4Q9CWX4 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Rpusd4Q9CWX4 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Rpusd4Q9CWX4 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Rpusd4Q9CWX4 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Rpusd4Q9CWX4 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Rpusd4Q9CWX4 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Rpusd4Q9CWX4 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Rpusd4Q9CWX4 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Rpusd4Q9CWX4 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Rpusd4Q9CWX4 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Rpusd4Q9CWX4 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Rpusd4Q9CWX4 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Rpusd4Q9CWX4 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Rpusd4Q9CWX4 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Rpusd4Q9CWX4 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Rpusd4Q9CWX4 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Rpusd4Q9CWX4 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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