Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSV6

Sft2d3, Vesicle transport protein SFT2C, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d3Q9CSV6 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sft2d3Q9CSV6 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Sft2d3Q9CSV6 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Sft2d3Q9CSV6 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Sft2d3Q9CSV6 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sft2d3Q9CSV6 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sft2d3Q9CSV6 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sft2d3Q9CSV6 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sft2d3Q9CSV6 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sft2d3Q9CSV6 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sft2d3Q9CSV6 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sft2d3Q9CSV6 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sft2d3Q9CSV6 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sft2d3Q9CSV6 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sft2d3Q9CSV6 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Sft2d3Q9CSV6 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Sft2d3Q9CSV6 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sft2d3Q9CSV6 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sft2d3Q9CSV6 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sft2d3Q9CSV6 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Sft2d3Q9CSV6 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sft2d3Q9CSV6 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sft2d3Q9CSV6 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sft2d3Q9CSV6 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sft2d3Q9CSV6 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Sft2d3Q9CSV6 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sft2d3Q9CSV6 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sft2d3Q9CSV6 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sft2d3Q9CSV6 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Sft2d3Q9CSV6 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sft2d3Q9CSV6 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sft2d3Q9CSV6 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sft2d3Q9CSV6 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sft2d3Q9CSV6 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Sft2d3Q9CSV6 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sft2d3Q9CSV6 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sft2d3Q9CSV6 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sft2d3Q9CSV6 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Sft2d3Q9CSV6 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sft2d3Q9CSV6 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sft2d3Q9CSV6 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sft2d3Q9CSV6 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sft2d3Q9CSV6 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sft2d3Q9CSV6 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sft2d3Q9CSV6 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sft2d3Q9CSV6 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sft2d3Q9CSV6 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sft2d3Q9CSV6 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sft2d3Q9CSV6 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sft2d3Q9CSV6 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sft2d3Q9CSV6 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sft2d3Q9CSV6 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sft2d3Q9CSV6 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sft2d3Q9CSV6 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sft2d3Q9CSV6 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sft2d3Q9CSV6 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sft2d3Q9CSV6 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sft2d3Q9CSV6 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sft2d3Q9CSV6 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sft2d3Q9CSV6 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sft2d3Q9CSV6 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sft2d3Q9CSV6 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sft2d3Q9CSV6 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sft2d3Q9CSV6 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Sft2d3Q9CSV6 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sft2d3Q9CSV6 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sft2d3Q9CSV6 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Sft2d3Q9CSV6 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Sft2d3Q9CSV6 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sft2d3Q9CSV6 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sft2d3Q9CSV6 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sft2d3Q9CSV6 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sft2d3Q9CSV6 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Sft2d3Q9CSV6 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sft2d3Q9CSV6 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sft2d3Q9CSV6 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sft2d3Q9CSV6 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sft2d3Q9CSV6 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sft2d3Q9CSV6 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sft2d3Q9CSV6 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sft2d3Q9CSV6 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sft2d3Q9CSV6 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sft2d3Q9CSV6 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sft2d3Q9CSV6 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Sft2d3Q9CSV6 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sft2d3Q9CSV6 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Sft2d3Q9CSV6 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sft2d3Q9CSV6 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sft2d3Q9CSV6 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sft2d3Q9CSV6 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sft2d3Q9CSV6 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sft2d3Q9CSV6 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sft2d3Q9CSV6 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sft2d3Q9CSV6 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sft2d3Q9CSV6 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sft2d3Q9CSV6 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sft2d3Q9CSV6 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sft2d3Q9CSV6 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sft2d3Q9CSV6 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sft2d3Q9CSV6 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.7 ms