Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRC3

UPF0235 protein C15orf40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CRC3 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q9CRC3 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q9CRC3 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q9CRC3 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Q9CRC3 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Q9CRC3 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q9CRC3 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q9CRC3 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q9CRC3 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q9CRC3 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q9CRC3 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q9CRC3 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q9CRC3 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q9CRC3 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q9CRC3 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Q9CRC3 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q9CRC3 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q9CRC3 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q9CRC3 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q9CRC3 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Q9CRC3 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q9CRC3 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q9CRC3 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q9CRC3 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q9CRC3 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q9CRC3 Olfr1490-202ENSMUST00000213900 5165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q9CRC3 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q9CRC3 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q9CRC3 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q9CRC3 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q9CRC3 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q9CRC3 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q9CRC3 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q9CRC3 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q9CRC3 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q9CRC3 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q9CRC3 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q9CRC3 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q9CRC3 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q9CRC3 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q9CRC3 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q9CRC3 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Q9CRC3 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Q9CRC3 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q9CRC3 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Q9CRC3 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q9CRC3 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q9CRC3 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Q9CRC3 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q9CRC3 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q9CRC3 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q9CRC3 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q9CRC3 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q9CRC3 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q9CRC3 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q9CRC3 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q9CRC3 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q9CRC3 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Q9CRC3 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q9CRC3 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q9CRC3 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q9CRC3 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q9CRC3 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q9CRC3 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q9CRC3 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q9CRC3 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q9CRC3 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Q9CRC3 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Q9CRC3 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Q9CRC3 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q9CRC3 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q9CRC3 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q9CRC3 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q9CRC3 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q9CRC3 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q9CRC3 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q9CRC3 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q9CRC3 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q9CRC3 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q9CRC3 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q9CRC3 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q9CRC3 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q9CRC3 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q9CRC3 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q9CRC3 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q9CRC3 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q9CRC3 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q9CRC3 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q9CRC3 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q9CRC3 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q9CRC3 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q9CRC3 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q9CRC3 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q9CRC3 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Q9CRC3 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q9CRC3 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Q9CRC3 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q9CRC3 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q9CRC3 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Q9CRC3 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms