Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW1

Ykt6, Synaptobrevin homolog YKT6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ykt6Q9CQW1 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ykt6Q9CQW1 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ykt6Q9CQW1 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ykt6Q9CQW1 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ykt6Q9CQW1 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ykt6Q9CQW1 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ykt6Q9CQW1 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Ykt6Q9CQW1 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Ykt6Q9CQW1 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Ykt6Q9CQW1 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Ykt6Q9CQW1 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ykt6Q9CQW1 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ykt6Q9CQW1 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ykt6Q9CQW1 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Ykt6Q9CQW1 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Ykt6Q9CQW1 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ykt6Q9CQW1 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ykt6Q9CQW1 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ykt6Q9CQW1 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ykt6Q9CQW1 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ykt6Q9CQW1 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ykt6Q9CQW1 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ykt6Q9CQW1 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ykt6Q9CQW1 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ykt6Q9CQW1 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ykt6Q9CQW1 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Ykt6Q9CQW1 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ykt6Q9CQW1 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ykt6Q9CQW1 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ykt6Q9CQW1 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ykt6Q9CQW1 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ykt6Q9CQW1 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ykt6Q9CQW1 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ykt6Q9CQW1 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ykt6Q9CQW1 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ykt6Q9CQW1 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ykt6Q9CQW1 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ykt6Q9CQW1 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ykt6Q9CQW1 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ykt6Q9CQW1 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ykt6Q9CQW1 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ykt6Q9CQW1 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ykt6Q9CQW1 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ykt6Q9CQW1 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Ykt6Q9CQW1 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ykt6Q9CQW1 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ykt6Q9CQW1 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ykt6Q9CQW1 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Ykt6Q9CQW1 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ykt6Q9CQW1 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ykt6Q9CQW1 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ykt6Q9CQW1 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Ykt6Q9CQW1 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Ykt6Q9CQW1 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Ykt6Q9CQW1 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ykt6Q9CQW1 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ykt6Q9CQW1 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ykt6Q9CQW1 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Ykt6Q9CQW1 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ykt6Q9CQW1 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ykt6Q9CQW1 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ykt6Q9CQW1 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ykt6Q9CQW1 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ykt6Q9CQW1 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ykt6Q9CQW1 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ykt6Q9CQW1 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ykt6Q9CQW1 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ykt6Q9CQW1 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ykt6Q9CQW1 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ykt6Q9CQW1 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ykt6Q9CQW1 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ykt6Q9CQW1 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ykt6Q9CQW1 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ykt6Q9CQW1 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ykt6Q9CQW1 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ykt6Q9CQW1 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ykt6Q9CQW1 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ykt6Q9CQW1 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ykt6Q9CQW1 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ykt6Q9CQW1 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ykt6Q9CQW1 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ykt6Q9CQW1 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ykt6Q9CQW1 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ykt6Q9CQW1 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ykt6Q9CQW1 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ykt6Q9CQW1 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Ykt6Q9CQW1 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ykt6Q9CQW1 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ykt6Q9CQW1 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ykt6Q9CQW1 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ykt6Q9CQW1 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ykt6Q9CQW1 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Ykt6Q9CQW1 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ykt6Q9CQW1 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Ykt6Q9CQW1 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ykt6Q9CQW1 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ykt6Q9CQW1 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Ykt6Q9CQW1 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ykt6Q9CQW1 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Ykt6Q9CQW1 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.1 ms