Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQT5

Pomp, Proteasome maturation protein, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PompQ9CQT5 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PompQ9CQT5 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PompQ9CQT5 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PompQ9CQT5 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PompQ9CQT5 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PompQ9CQT5 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PompQ9CQT5 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PompQ9CQT5 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PompQ9CQT5 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PompQ9CQT5 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PompQ9CQT5 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PompQ9CQT5 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PompQ9CQT5 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PompQ9CQT5 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PompQ9CQT5 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PompQ9CQT5 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PompQ9CQT5 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PompQ9CQT5 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PompQ9CQT5 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
PompQ9CQT5 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PompQ9CQT5 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PompQ9CQT5 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PompQ9CQT5 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PompQ9CQT5 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PompQ9CQT5 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PompQ9CQT5 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PompQ9CQT5 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PompQ9CQT5 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PompQ9CQT5 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
PompQ9CQT5 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
PompQ9CQT5 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PompQ9CQT5 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
PompQ9CQT5 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
PompQ9CQT5 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PompQ9CQT5 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
PompQ9CQT5 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PompQ9CQT5 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PompQ9CQT5 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PompQ9CQT5 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PompQ9CQT5 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PompQ9CQT5 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PompQ9CQT5 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PompQ9CQT5 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PompQ9CQT5 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PompQ9CQT5 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PompQ9CQT5 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PompQ9CQT5 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PompQ9CQT5 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PompQ9CQT5 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PompQ9CQT5 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
PompQ9CQT5 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PompQ9CQT5 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PompQ9CQT5 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PompQ9CQT5 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PompQ9CQT5 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PompQ9CQT5 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PompQ9CQT5 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PompQ9CQT5 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PompQ9CQT5 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PompQ9CQT5 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PompQ9CQT5 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PompQ9CQT5 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PompQ9CQT5 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PompQ9CQT5 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PompQ9CQT5 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PompQ9CQT5 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PompQ9CQT5 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PompQ9CQT5 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PompQ9CQT5 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PompQ9CQT5 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PompQ9CQT5 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PompQ9CQT5 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PompQ9CQT5 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PompQ9CQT5 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PompQ9CQT5 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PompQ9CQT5 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PompQ9CQT5 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PompQ9CQT5 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PompQ9CQT5 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
PompQ9CQT5 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PompQ9CQT5 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
PompQ9CQT5 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PompQ9CQT5 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PompQ9CQT5 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PompQ9CQT5 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PompQ9CQT5 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PompQ9CQT5 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PompQ9CQT5 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PompQ9CQT5 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PompQ9CQT5 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PompQ9CQT5 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PompQ9CQT5 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PompQ9CQT5 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PompQ9CQT5 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PompQ9CQT5 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
PompQ9CQT5 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PompQ9CQT5 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PompQ9CQT5 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PompQ9CQT5 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PompQ9CQT5 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms