Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL2

Ccer1, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer1Q9CQL2 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccer1Q9CQL2 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccer1Q9CQL2 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccer1Q9CQL2 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccer1Q9CQL2 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccer1Q9CQL2 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccer1Q9CQL2 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccer1Q9CQL2 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccer1Q9CQL2 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccer1Q9CQL2 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccer1Q9CQL2 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccer1Q9CQL2 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccer1Q9CQL2 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccer1Q9CQL2 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccer1Q9CQL2 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccer1Q9CQL2 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccer1Q9CQL2 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccer1Q9CQL2 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccer1Q9CQL2 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccer1Q9CQL2 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccer1Q9CQL2 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccer1Q9CQL2 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccer1Q9CQL2 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccer1Q9CQL2 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccer1Q9CQL2 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccer1Q9CQL2 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccer1Q9CQL2 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccer1Q9CQL2 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccer1Q9CQL2 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccer1Q9CQL2 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccer1Q9CQL2 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccer1Q9CQL2 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccer1Q9CQL2 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccer1Q9CQL2 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccer1Q9CQL2 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccer1Q9CQL2 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccer1Q9CQL2 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccer1Q9CQL2 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccer1Q9CQL2 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccer1Q9CQL2 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccer1Q9CQL2 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccer1Q9CQL2 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccer1Q9CQL2 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
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Ccer1Q9CQL2 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccer1Q9CQL2 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccer1Q9CQL2 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccer1Q9CQL2 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccer1Q9CQL2 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccer1Q9CQL2 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccer1Q9CQL2 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccer1Q9CQL2 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
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Ccer1Q9CQL2 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccer1Q9CQL2 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccer1Q9CQL2 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccer1Q9CQL2 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccer1Q9CQL2 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccer1Q9CQL2 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccer1Q9CQL2 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccer1Q9CQL2 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccer1Q9CQL2 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccer1Q9CQL2 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccer1Q9CQL2 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccer1Q9CQL2 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccer1Q9CQL2 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccer1Q9CQL2 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccer1Q9CQL2 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccer1Q9CQL2 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccer1Q9CQL2 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccer1Q9CQL2 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccer1Q9CQL2 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccer1Q9CQL2 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccer1Q9CQL2 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccer1Q9CQL2 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccer1Q9CQL2 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccer1Q9CQL2 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccer1Q9CQL2 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccer1Q9CQL2 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccer1Q9CQL2 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccer1Q9CQL2 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccer1Q9CQL2 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccer1Q9CQL2 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccer1Q9CQL2 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccer1Q9CQL2 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccer1Q9CQL2 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccer1Q9CQL2 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccer1Q9CQL2 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccer1Q9CQL2 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccer1Q9CQL2 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccer1Q9CQL2 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccer1Q9CQL2 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccer1Q9CQL2 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccer1Q9CQL2 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccer1Q9CQL2 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccer1Q9CQL2 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccer1Q9CQL2 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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