Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD1

Rab5a, Ras-related protein Rab-5A, mousemouse

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5aQ9CQD1 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
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