Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC3

Protein C9orf135 homolog, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQC3 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q9CQC3 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q9CQC3 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q9CQC3 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q9CQC3 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q9CQC3 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q9CQC3 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q9CQC3 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q9CQC3 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q9CQC3 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q9CQC3 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q9CQC3 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q9CQC3 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q9CQC3 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q9CQC3 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q9CQC3 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q9CQC3 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q9CQC3 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q9CQC3 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q9CQC3 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q9CQC3 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q9CQC3 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q9CQC3 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q9CQC3 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q9CQC3 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q9CQC3 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q9CQC3 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q9CQC3 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Q9CQC3 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Q9CQC3 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Q9CQC3 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Q9CQC3 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q9CQC3 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Q9CQC3 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q9CQC3 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q9CQC3 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q9CQC3 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q9CQC3 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q9CQC3 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q9CQC3 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Q9CQC3 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q9CQC3 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q9CQC3 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q9CQC3 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q9CQC3 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q9CQC3 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q9CQC3 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Q9CQC3 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.65□□□□□ -0.23
Q9CQC3 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Q9CQC3 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Q9CQC3 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q9CQC3 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q9CQC3 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q9CQC3 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q9CQC3 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q9CQC3 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q9CQC3 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q9CQC3 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q9CQC3 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q9CQC3 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q9CQC3 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q9CQC3 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q9CQC3 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q9CQC3 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q9CQC3 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q9CQC3 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q9CQC3 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q9CQC3 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Q9CQC3 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q9CQC3 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q9CQC3 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q9CQC3 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q9CQC3 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q9CQC3 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q9CQC3 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q9CQC3 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q9CQC3 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q9CQC3 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q9CQC3 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q9CQC3 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q9CQC3 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q9CQC3 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q9CQC3 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q9CQC3 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q9CQC3 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q9CQC3 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q9CQC3 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q9CQC3 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q9CQC3 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q9CQC3 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q9CQC3 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q9CQC3 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q9CQC3 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q9CQC3 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q9CQC3 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q9CQC3 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q9CQC3 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q9CQC3 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q9CQC3 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Q9CQC3 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
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