Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB9

Sf3b1, Splicing factor 3B subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b1Q99NB9 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Sf3b1Q99NB9 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sf3b1Q99NB9 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Sf3b1Q99NB9 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sf3b1Q99NB9 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
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Sf3b1Q99NB9 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Sf3b1Q99NB9 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sf3b1Q99NB9 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Sf3b1Q99NB9 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sf3b1Q99NB9 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Sf3b1Q99NB9 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Sf3b1Q99NB9 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sf3b1Q99NB9 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sf3b1Q99NB9 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sf3b1Q99NB9 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sf3b1Q99NB9 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sf3b1Q99NB9 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sf3b1Q99NB9 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sf3b1Q99NB9 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sf3b1Q99NB9 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sf3b1Q99NB9 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Sf3b1Q99NB9 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Sf3b1Q99NB9 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sf3b1Q99NB9 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sf3b1Q99NB9 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sf3b1Q99NB9 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
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