Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp1b4Q99ME6 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp1b4Q99ME6 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp1b4Q99ME6 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp1b4Q99ME6 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp1b4Q99ME6 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp1b4Q99ME6 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp1b4Q99ME6 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp1b4Q99ME6 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp1b4Q99ME6 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp1b4Q99ME6 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp1b4Q99ME6 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp1b4Q99ME6 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp1b4Q99ME6 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp1b4Q99ME6 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp1b4Q99ME6 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp1b4Q99ME6 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp1b4Q99ME6 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp1b4Q99ME6 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp1b4Q99ME6 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp1b4Q99ME6 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp1b4Q99ME6 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp1b4Q99ME6 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp1b4Q99ME6 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp1b4Q99ME6 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp1b4Q99ME6 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp1b4Q99ME6 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp1b4Q99ME6 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp1b4Q99ME6 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp1b4Q99ME6 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp1b4Q99ME6 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp1b4Q99ME6 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp1b4Q99ME6 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp1b4Q99ME6 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp1b4Q99ME6 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp1b4Q99ME6 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp1b4Q99ME6 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp1b4Q99ME6 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp1b4Q99ME6 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp1b4Q99ME6 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp1b4Q99ME6 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp1b4Q99ME6 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp1b4Q99ME6 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp1b4Q99ME6 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp1b4Q99ME6 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp1b4Q99ME6 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp1b4Q99ME6 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp1b4Q99ME6 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp1b4Q99ME6 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp1b4Q99ME6 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp1b4Q99ME6 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp1b4Q99ME6 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp1b4Q99ME6 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp1b4Q99ME6 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp1b4Q99ME6 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp1b4Q99ME6 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp1b4Q99ME6 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp1b4Q99ME6 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp1b4Q99ME6 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp1b4Q99ME6 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp1b4Q99ME6 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp1b4Q99ME6 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp1b4Q99ME6 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp1b4Q99ME6 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp1b4Q99ME6 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp1b4Q99ME6 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp1b4Q99ME6 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp1b4Q99ME6 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp1b4Q99ME6 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp1b4Q99ME6 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp1b4Q99ME6 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atp1b4Q99ME6 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atp1b4Q99ME6 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atp1b4Q99ME6 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atp1b4Q99ME6 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atp1b4Q99ME6 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atp1b4Q99ME6 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atp1b4Q99ME6 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atp1b4Q99ME6 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atp1b4Q99ME6 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atp1b4Q99ME6 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atp1b4Q99ME6 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atp1b4Q99ME6 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atp1b4Q99ME6 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atp1b4Q99ME6 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atp1b4Q99ME6 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atp1b4Q99ME6 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Atp1b4Q99ME6 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Atp1b4Q99ME6 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atp1b4Q99ME6 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Atp1b4Q99ME6 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Atp1b4Q99ME6 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Atp1b4Q99ME6 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Atp1b4Q99ME6 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atp1b4Q99ME6 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atp1b4Q99ME6 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atp1b4Q99ME6 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atp1b4Q99ME6 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atp1b4Q99ME6 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atp1b4Q99ME6 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms