Protein–RNA interactions for Protein: Q99LH9

Sh3bp5l, SH3 domain-binding protein 5-like, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5lQ99LH9 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sh3bp5lQ99LH9 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sh3bp5lQ99LH9 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Sh3bp5lQ99LH9 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sh3bp5lQ99LH9 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sh3bp5lQ99LH9 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sh3bp5lQ99LH9 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sh3bp5lQ99LH9 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sh3bp5lQ99LH9 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Sh3bp5lQ99LH9 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sh3bp5lQ99LH9 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3bp5lQ99LH9 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3bp5lQ99LH9 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3bp5lQ99LH9 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3bp5lQ99LH9 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3bp5lQ99LH9 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3bp5lQ99LH9 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3bp5lQ99LH9 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3bp5lQ99LH9 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3bp5lQ99LH9 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3bp5lQ99LH9 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3bp5lQ99LH9 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3bp5lQ99LH9 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3bp5lQ99LH9 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms