Protein–RNA interactions for Protein: Q99L02

Pagr1a, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1aQ99L02 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms