Protein–RNA interactions for Protein: Q99KG7

Hps4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps4Q99KG7 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms