Protein–RNA interactions for Protein: Q921M3

Sf3b3, Splicing factor 3B subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b3Q921M3 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf3b3Q921M3 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf3b3Q921M3 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf3b3Q921M3 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf3b3Q921M3 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf3b3Q921M3 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf3b3Q921M3 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf3b3Q921M3 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf3b3Q921M3 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf3b3Q921M3 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf3b3Q921M3 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf3b3Q921M3 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf3b3Q921M3 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf3b3Q921M3 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf3b3Q921M3 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf3b3Q921M3 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf3b3Q921M3 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf3b3Q921M3 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf3b3Q921M3 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf3b3Q921M3 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf3b3Q921M3 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf3b3Q921M3 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf3b3Q921M3 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf3b3Q921M3 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf3b3Q921M3 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf3b3Q921M3 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf3b3Q921M3 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf3b3Q921M3 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf3b3Q921M3 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf3b3Q921M3 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf3b3Q921M3 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf3b3Q921M3 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf3b3Q921M3 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf3b3Q921M3 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf3b3Q921M3 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf3b3Q921M3 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf3b3Q921M3 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf3b3Q921M3 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf3b3Q921M3 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf3b3Q921M3 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf3b3Q921M3 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf3b3Q921M3 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf3b3Q921M3 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf3b3Q921M3 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf3b3Q921M3 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf3b3Q921M3 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf3b3Q921M3 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf3b3Q921M3 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf3b3Q921M3 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf3b3Q921M3 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf3b3Q921M3 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf3b3Q921M3 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf3b3Q921M3 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf3b3Q921M3 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf3b3Q921M3 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf3b3Q921M3 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf3b3Q921M3 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf3b3Q921M3 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf3b3Q921M3 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf3b3Q921M3 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf3b3Q921M3 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf3b3Q921M3 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf3b3Q921M3 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf3b3Q921M3 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf3b3Q921M3 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf3b3Q921M3 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf3b3Q921M3 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf3b3Q921M3 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf3b3Q921M3 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf3b3Q921M3 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf3b3Q921M3 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf3b3Q921M3 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf3b3Q921M3 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf3b3Q921M3 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf3b3Q921M3 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf3b3Q921M3 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf3b3Q921M3 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf3b3Q921M3 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf3b3Q921M3 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf3b3Q921M3 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf3b3Q921M3 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf3b3Q921M3 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf3b3Q921M3 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf3b3Q921M3 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf3b3Q921M3 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf3b3Q921M3 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf3b3Q921M3 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf3b3Q921M3 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf3b3Q921M3 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf3b3Q921M3 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf3b3Q921M3 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf3b3Q921M3 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf3b3Q921M3 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf3b3Q921M3 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf3b3Q921M3 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf3b3Q921M3 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf3b3Q921M3 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf3b3Q921M3 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf3b3Q921M3 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf3b3Q921M3 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms