Protein–RNA interactions for Protein: Q91YH5

Atl3, Atlastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl3Q91YH5 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atl3Q91YH5 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atl3Q91YH5 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atl3Q91YH5 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atl3Q91YH5 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atl3Q91YH5 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Atl3Q91YH5 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atl3Q91YH5 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atl3Q91YH5 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atl3Q91YH5 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Atl3Q91YH5 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atl3Q91YH5 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atl3Q91YH5 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atl3Q91YH5 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atl3Q91YH5 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atl3Q91YH5 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atl3Q91YH5 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atl3Q91YH5 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atl3Q91YH5 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atl3Q91YH5 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atl3Q91YH5 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atl3Q91YH5 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atl3Q91YH5 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Atl3Q91YH5 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Atl3Q91YH5 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atl3Q91YH5 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atl3Q91YH5 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atl3Q91YH5 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atl3Q91YH5 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Atl3Q91YH5 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Atl3Q91YH5 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Atl3Q91YH5 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Atl3Q91YH5 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Atl3Q91YH5 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Atl3Q91YH5 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Atl3Q91YH5 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Atl3Q91YH5 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atl3Q91YH5 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atl3Q91YH5 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atl3Q91YH5 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atl3Q91YH5 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atl3Q91YH5 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atl3Q91YH5 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atl3Q91YH5 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atl3Q91YH5 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Atl3Q91YH5 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atl3Q91YH5 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atl3Q91YH5 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atl3Q91YH5 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atl3Q91YH5 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atl3Q91YH5 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atl3Q91YH5 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atl3Q91YH5 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atl3Q91YH5 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atl3Q91YH5 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atl3Q91YH5 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atl3Q91YH5 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atl3Q91YH5 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Atl3Q91YH5 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Atl3Q91YH5 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atl3Q91YH5 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atl3Q91YH5 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atl3Q91YH5 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atl3Q91YH5 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atl3Q91YH5 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atl3Q91YH5 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atl3Q91YH5 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atl3Q91YH5 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atl3Q91YH5 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atl3Q91YH5 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atl3Q91YH5 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atl3Q91YH5 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atl3Q91YH5 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Atl3Q91YH5 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atl3Q91YH5 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atl3Q91YH5 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atl3Q91YH5 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atl3Q91YH5 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atl3Q91YH5 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atl3Q91YH5 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atl3Q91YH5 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atl3Q91YH5 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Atl3Q91YH5 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Atl3Q91YH5 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atl3Q91YH5 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atl3Q91YH5 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atl3Q91YH5 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atl3Q91YH5 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atl3Q91YH5 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Atl3Q91YH5 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atl3Q91YH5 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atl3Q91YH5 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atl3Q91YH5 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atl3Q91YH5 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atl3Q91YH5 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atl3Q91YH5 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atl3Q91YH5 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atl3Q91YH5 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atl3Q91YH5 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Atl3Q91YH5 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms