Protein–RNA interactions for Protein: Q91W78

Usb1, U6 snRNA phosphodiesterase, mousemouse

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Length 267 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usb1Q91W78 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Usb1Q91W78 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Usb1Q91W78 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Usb1Q91W78 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usb1Q91W78 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Usb1Q91W78 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Usb1Q91W78 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usb1Q91W78 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usb1Q91W78 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usb1Q91W78 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Usb1Q91W78 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Usb1Q91W78 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usb1Q91W78 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Usb1Q91W78 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Usb1Q91W78 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Usb1Q91W78 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usb1Q91W78 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Usb1Q91W78 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usb1Q91W78 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usb1Q91W78 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usb1Q91W78 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usb1Q91W78 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usb1Q91W78 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usb1Q91W78 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usb1Q91W78 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usb1Q91W78 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usb1Q91W78 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usb1Q91W78 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usb1Q91W78 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Usb1Q91W78 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usb1Q91W78 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usb1Q91W78 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usb1Q91W78 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usb1Q91W78 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usb1Q91W78 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usb1Q91W78 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usb1Q91W78 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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