Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEJ3

Dkk4, Dickkopf-related protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk4Q8VEJ3 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Dkk4Q8VEJ3 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Dkk4Q8VEJ3 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Dkk4Q8VEJ3 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Dkk4Q8VEJ3 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Dkk4Q8VEJ3 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Dkk4Q8VEJ3 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Dkk4Q8VEJ3 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Dkk4Q8VEJ3 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Dkk4Q8VEJ3 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Dkk4Q8VEJ3 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Dkk4Q8VEJ3 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Dkk4Q8VEJ3 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Dkk4Q8VEJ3 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Dkk4Q8VEJ3 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Dkk4Q8VEJ3 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Dkk4Q8VEJ3 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Dkk4Q8VEJ3 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Dkk4Q8VEJ3 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Dkk4Q8VEJ3 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Dkk4Q8VEJ3 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Dkk4Q8VEJ3 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Dkk4Q8VEJ3 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Dkk4Q8VEJ3 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Dkk4Q8VEJ3 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Dkk4Q8VEJ3 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Dkk4Q8VEJ3 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Dkk4Q8VEJ3 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Dkk4Q8VEJ3 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Dkk4Q8VEJ3 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Dkk4Q8VEJ3 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Dkk4Q8VEJ3 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Dkk4Q8VEJ3 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Dkk4Q8VEJ3 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Dkk4Q8VEJ3 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Dkk4Q8VEJ3 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Dkk4Q8VEJ3 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Dkk4Q8VEJ3 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Dkk4Q8VEJ3 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Dkk4Q8VEJ3 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Dkk4Q8VEJ3 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Dkk4Q8VEJ3 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Dkk4Q8VEJ3 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Dkk4Q8VEJ3 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Dkk4Q8VEJ3 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Dkk4Q8VEJ3 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Dkk4Q8VEJ3 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Dkk4Q8VEJ3 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Dkk4Q8VEJ3 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Dkk4Q8VEJ3 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Dkk4Q8VEJ3 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Dkk4Q8VEJ3 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Dkk4Q8VEJ3 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Dkk4Q8VEJ3 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Dkk4Q8VEJ3 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Dkk4Q8VEJ3 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Dkk4Q8VEJ3 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Dkk4Q8VEJ3 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Dkk4Q8VEJ3 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Dkk4Q8VEJ3 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Dkk4Q8VEJ3 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Dkk4Q8VEJ3 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Dkk4Q8VEJ3 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Dkk4Q8VEJ3 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Dkk4Q8VEJ3 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Dkk4Q8VEJ3 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Dkk4Q8VEJ3 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Dkk4Q8VEJ3 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Dkk4Q8VEJ3 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Dkk4Q8VEJ3 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Dkk4Q8VEJ3 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Dkk4Q8VEJ3 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Dkk4Q8VEJ3 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Dkk4Q8VEJ3 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Dkk4Q8VEJ3 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Dkk4Q8VEJ3 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Dkk4Q8VEJ3 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Dkk4Q8VEJ3 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Dkk4Q8VEJ3 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Dkk4Q8VEJ3 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Dkk4Q8VEJ3 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Dkk4Q8VEJ3 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Dkk4Q8VEJ3 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Dkk4Q8VEJ3 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Dkk4Q8VEJ3 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Dkk4Q8VEJ3 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Dkk4Q8VEJ3 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Dkk4Q8VEJ3 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Dkk4Q8VEJ3 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Dkk4Q8VEJ3 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Dkk4Q8VEJ3 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Dkk4Q8VEJ3 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Dkk4Q8VEJ3 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Dkk4Q8VEJ3 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Dkk4Q8VEJ3 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Dkk4Q8VEJ3 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Dkk4Q8VEJ3 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Dkk4Q8VEJ3 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Dkk4Q8VEJ3 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Dkk4Q8VEJ3 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms