Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD57

Sft2d2, Vesicle transport protein SFT2B, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d2Q8VD57 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sft2d2Q8VD57 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sft2d2Q8VD57 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sft2d2Q8VD57 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sft2d2Q8VD57 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sft2d2Q8VD57 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sft2d2Q8VD57 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sft2d2Q8VD57 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sft2d2Q8VD57 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sft2d2Q8VD57 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sft2d2Q8VD57 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sft2d2Q8VD57 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sft2d2Q8VD57 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sft2d2Q8VD57 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sft2d2Q8VD57 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sft2d2Q8VD57 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sft2d2Q8VD57 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sft2d2Q8VD57 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sft2d2Q8VD57 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sft2d2Q8VD57 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Sft2d2Q8VD57 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sft2d2Q8VD57 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Sft2d2Q8VD57 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Sft2d2Q8VD57 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Sft2d2Q8VD57 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sft2d2Q8VD57 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sft2d2Q8VD57 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sft2d2Q8VD57 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sft2d2Q8VD57 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Sft2d2Q8VD57 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Sft2d2Q8VD57 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sft2d2Q8VD57 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sft2d2Q8VD57 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Sft2d2Q8VD57 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Sft2d2Q8VD57 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sft2d2Q8VD57 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sft2d2Q8VD57 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sft2d2Q8VD57 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sft2d2Q8VD57 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sft2d2Q8VD57 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sft2d2Q8VD57 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sft2d2Q8VD57 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sft2d2Q8VD57 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sft2d2Q8VD57 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sft2d2Q8VD57 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sft2d2Q8VD57 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sft2d2Q8VD57 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sft2d2Q8VD57 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sft2d2Q8VD57 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sft2d2Q8VD57 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Sft2d2Q8VD57 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sft2d2Q8VD57 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sft2d2Q8VD57 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sft2d2Q8VD57 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sft2d2Q8VD57 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Sft2d2Q8VD57 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sft2d2Q8VD57 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sft2d2Q8VD57 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sft2d2Q8VD57 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sft2d2Q8VD57 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
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