Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2Q0

Trim29, Tripartite motif-containing protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim29Q8R2Q0 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim29Q8R2Q0 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim29Q8R2Q0 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Trim29Q8R2Q0 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trim29Q8R2Q0 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Trim29Q8R2Q0 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Trim29Q8R2Q0 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim29Q8R2Q0 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim29Q8R2Q0 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trim29Q8R2Q0 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim29Q8R2Q0 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim29Q8R2Q0 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim29Q8R2Q0 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim29Q8R2Q0 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim29Q8R2Q0 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim29Q8R2Q0 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim29Q8R2Q0 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim29Q8R2Q0 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim29Q8R2Q0 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim29Q8R2Q0 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim29Q8R2Q0 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Trim29Q8R2Q0 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim29Q8R2Q0 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim29Q8R2Q0 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Trim29Q8R2Q0 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Trim29Q8R2Q0 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trim29Q8R2Q0 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trim29Q8R2Q0 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trim29Q8R2Q0 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trim29Q8R2Q0 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trim29Q8R2Q0 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trim29Q8R2Q0 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim29Q8R2Q0 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Trim29Q8R2Q0 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim29Q8R2Q0 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Trim29Q8R2Q0 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim29Q8R2Q0 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim29Q8R2Q0 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Trim29Q8R2Q0 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Trim29Q8R2Q0 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim29Q8R2Q0 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Trim29Q8R2Q0 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim29Q8R2Q0 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim29Q8R2Q0 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Trim29Q8R2Q0 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim29Q8R2Q0 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim29Q8R2Q0 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim29Q8R2Q0 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim29Q8R2Q0 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Trim29Q8R2Q0 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim29Q8R2Q0 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim29Q8R2Q0 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim29Q8R2Q0 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Trim29Q8R2Q0 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Trim29Q8R2Q0 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim29Q8R2Q0 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim29Q8R2Q0 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Trim29Q8R2Q0 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim29Q8R2Q0 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim29Q8R2Q0 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trim29Q8R2Q0 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trim29Q8R2Q0 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Trim29Q8R2Q0 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim29Q8R2Q0 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim29Q8R2Q0 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim29Q8R2Q0 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trim29Q8R2Q0 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim29Q8R2Q0 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Trim29Q8R2Q0 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Trim29Q8R2Q0 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Trim29Q8R2Q0 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim29Q8R2Q0 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim29Q8R2Q0 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Trim29Q8R2Q0 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim29Q8R2Q0 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim29Q8R2Q0 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim29Q8R2Q0 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Trim29Q8R2Q0 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Trim29Q8R2Q0 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Trim29Q8R2Q0 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim29Q8R2Q0 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trim29Q8R2Q0 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim29Q8R2Q0 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim29Q8R2Q0 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Trim29Q8R2Q0 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim29Q8R2Q0 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim29Q8R2Q0 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Trim29Q8R2Q0 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim29Q8R2Q0 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim29Q8R2Q0 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim29Q8R2Q0 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Trim29Q8R2Q0 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Trim29Q8R2Q0 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim29Q8R2Q0 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Trim29Q8R2Q0 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim29Q8R2Q0 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Trim29Q8R2Q0 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim29Q8R2Q0 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim29Q8R2Q0 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Trim29Q8R2Q0 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms