Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4P8

Hecw1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw1Q8K4P8 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hecw1Q8K4P8 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hecw1Q8K4P8 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hecw1Q8K4P8 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hecw1Q8K4P8 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hecw1Q8K4P8 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hecw1Q8K4P8 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hecw1Q8K4P8 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hecw1Q8K4P8 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hecw1Q8K4P8 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hecw1Q8K4P8 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hecw1Q8K4P8 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hecw1Q8K4P8 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hecw1Q8K4P8 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hecw1Q8K4P8 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hecw1Q8K4P8 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hecw1Q8K4P8 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Hecw1Q8K4P8 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Hecw1Q8K4P8 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hecw1Q8K4P8 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Hecw1Q8K4P8 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hecw1Q8K4P8 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hecw1Q8K4P8 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hecw1Q8K4P8 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hecw1Q8K4P8 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hecw1Q8K4P8 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hecw1Q8K4P8 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hecw1Q8K4P8 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hecw1Q8K4P8 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hecw1Q8K4P8 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hecw1Q8K4P8 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hecw1Q8K4P8 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hecw1Q8K4P8 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hecw1Q8K4P8 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hecw1Q8K4P8 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hecw1Q8K4P8 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hecw1Q8K4P8 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hecw1Q8K4P8 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hecw1Q8K4P8 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hecw1Q8K4P8 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hecw1Q8K4P8 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Hecw1Q8K4P8 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Hecw1Q8K4P8 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hecw1Q8K4P8 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hecw1Q8K4P8 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Hecw1Q8K4P8 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hecw1Q8K4P8 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hecw1Q8K4P8 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hecw1Q8K4P8 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Hecw1Q8K4P8 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hecw1Q8K4P8 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hecw1Q8K4P8 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hecw1Q8K4P8 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hecw1Q8K4P8 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hecw1Q8K4P8 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hecw1Q8K4P8 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hecw1Q8K4P8 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hecw1Q8K4P8 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hecw1Q8K4P8 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hecw1Q8K4P8 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hecw1Q8K4P8 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hecw1Q8K4P8 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hecw1Q8K4P8 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hecw1Q8K4P8 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hecw1Q8K4P8 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hecw1Q8K4P8 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hecw1Q8K4P8 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hecw1Q8K4P8 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hecw1Q8K4P8 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hecw1Q8K4P8 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hecw1Q8K4P8 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hecw1Q8K4P8 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hecw1Q8K4P8 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hecw1Q8K4P8 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hecw1Q8K4P8 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hecw1Q8K4P8 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hecw1Q8K4P8 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hecw1Q8K4P8 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hecw1Q8K4P8 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hecw1Q8K4P8 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Hecw1Q8K4P8 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Hecw1Q8K4P8 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hecw1Q8K4P8 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hecw1Q8K4P8 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hecw1Q8K4P8 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hecw1Q8K4P8 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hecw1Q8K4P8 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hecw1Q8K4P8 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hecw1Q8K4P8 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hecw1Q8K4P8 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hecw1Q8K4P8 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hecw1Q8K4P8 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hecw1Q8K4P8 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hecw1Q8K4P8 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hecw1Q8K4P8 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hecw1Q8K4P8 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hecw1Q8K4P8 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Hecw1Q8K4P8 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hecw1Q8K4P8 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hecw1Q8K4P8 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms