Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3N2

Vmn1r188, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r188Q8K3N2 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vmn1r188Q8K3N2 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Vmn1r188Q8K3N2 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Vmn1r188Q8K3N2 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vmn1r188Q8K3N2 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vmn1r188Q8K3N2 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vmn1r188Q8K3N2 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vmn1r188Q8K3N2 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vmn1r188Q8K3N2 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vmn1r188Q8K3N2 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vmn1r188Q8K3N2 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vmn1r188Q8K3N2 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vmn1r188Q8K3N2 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vmn1r188Q8K3N2 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vmn1r188Q8K3N2 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vmn1r188Q8K3N2 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vmn1r188Q8K3N2 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vmn1r188Q8K3N2 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vmn1r188Q8K3N2 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vmn1r188Q8K3N2 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vmn1r188Q8K3N2 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vmn1r188Q8K3N2 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vmn1r188Q8K3N2 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Vmn1r188Q8K3N2 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vmn1r188Q8K3N2 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vmn1r188Q8K3N2 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vmn1r188Q8K3N2 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vmn1r188Q8K3N2 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vmn1r188Q8K3N2 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vmn1r188Q8K3N2 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vmn1r188Q8K3N2 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vmn1r188Q8K3N2 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vmn1r188Q8K3N2 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vmn1r188Q8K3N2 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vmn1r188Q8K3N2 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vmn1r188Q8K3N2 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vmn1r188Q8K3N2 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vmn1r188Q8K3N2 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vmn1r188Q8K3N2 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Vmn1r188Q8K3N2 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Vmn1r188Q8K3N2 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vmn1r188Q8K3N2 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Vmn1r188Q8K3N2 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vmn1r188Q8K3N2 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vmn1r188Q8K3N2 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vmn1r188Q8K3N2 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vmn1r188Q8K3N2 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vmn1r188Q8K3N2 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vmn1r188Q8K3N2 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vmn1r188Q8K3N2 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vmn1r188Q8K3N2 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vmn1r188Q8K3N2 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vmn1r188Q8K3N2 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Vmn1r188Q8K3N2 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vmn1r188Q8K3N2 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vmn1r188Q8K3N2 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vmn1r188Q8K3N2 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vmn1r188Q8K3N2 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vmn1r188Q8K3N2 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vmn1r188Q8K3N2 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vmn1r188Q8K3N2 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r188Q8K3N2 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r188Q8K3N2 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r188Q8K3N2 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r188Q8K3N2 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r188Q8K3N2 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r188Q8K3N2 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r188Q8K3N2 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r188Q8K3N2 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r188Q8K3N2 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r188Q8K3N2 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r188Q8K3N2 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r188Q8K3N2 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r188Q8K3N2 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r188Q8K3N2 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r188Q8K3N2 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r188Q8K3N2 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r188Q8K3N2 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r188Q8K3N2 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r188Q8K3N2 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r188Q8K3N2 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r188Q8K3N2 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r188Q8K3N2 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r188Q8K3N2 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r188Q8K3N2 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r188Q8K3N2 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r188Q8K3N2 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r188Q8K3N2 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r188Q8K3N2 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r188Q8K3N2 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r188Q8K3N2 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r188Q8K3N2 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r188Q8K3N2 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r188Q8K3N2 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r188Q8K3N2 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r188Q8K3N2 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r188Q8K3N2 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r188Q8K3N2 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r188Q8K3N2 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r188Q8K3N2 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms