Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3G5

Vrk3, Inactive serine/threonine-protein kinase VRK3, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vrk3Q8K3G5 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Vrk3Q8K3G5 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vrk3Q8K3G5 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vrk3Q8K3G5 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vrk3Q8K3G5 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vrk3Q8K3G5 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vrk3Q8K3G5 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vrk3Q8K3G5 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vrk3Q8K3G5 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vrk3Q8K3G5 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vrk3Q8K3G5 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vrk3Q8K3G5 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vrk3Q8K3G5 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vrk3Q8K3G5 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vrk3Q8K3G5 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vrk3Q8K3G5 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vrk3Q8K3G5 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vrk3Q8K3G5 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vrk3Q8K3G5 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vrk3Q8K3G5 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vrk3Q8K3G5 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vrk3Q8K3G5 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vrk3Q8K3G5 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vrk3Q8K3G5 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vrk3Q8K3G5 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vrk3Q8K3G5 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vrk3Q8K3G5 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Vrk3Q8K3G5 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Vrk3Q8K3G5 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vrk3Q8K3G5 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vrk3Q8K3G5 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vrk3Q8K3G5 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vrk3Q8K3G5 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vrk3Q8K3G5 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vrk3Q8K3G5 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Vrk3Q8K3G5 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Vrk3Q8K3G5 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vrk3Q8K3G5 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vrk3Q8K3G5 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vrk3Q8K3G5 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vrk3Q8K3G5 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vrk3Q8K3G5 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vrk3Q8K3G5 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vrk3Q8K3G5 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vrk3Q8K3G5 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vrk3Q8K3G5 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vrk3Q8K3G5 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vrk3Q8K3G5 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vrk3Q8K3G5 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vrk3Q8K3G5 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vrk3Q8K3G5 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vrk3Q8K3G5 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vrk3Q8K3G5 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vrk3Q8K3G5 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vrk3Q8K3G5 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vrk3Q8K3G5 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vrk3Q8K3G5 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vrk3Q8K3G5 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vrk3Q8K3G5 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vrk3Q8K3G5 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Vrk3Q8K3G5 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vrk3Q8K3G5 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Vrk3Q8K3G5 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vrk3Q8K3G5 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vrk3Q8K3G5 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vrk3Q8K3G5 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vrk3Q8K3G5 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vrk3Q8K3G5 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vrk3Q8K3G5 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vrk3Q8K3G5 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vrk3Q8K3G5 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Vrk3Q8K3G5 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vrk3Q8K3G5 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vrk3Q8K3G5 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Vrk3Q8K3G5 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vrk3Q8K3G5 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Vrk3Q8K3G5 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vrk3Q8K3G5 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vrk3Q8K3G5 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Vrk3Q8K3G5 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vrk3Q8K3G5 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vrk3Q8K3G5 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vrk3Q8K3G5 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vrk3Q8K3G5 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vrk3Q8K3G5 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Vrk3Q8K3G5 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vrk3Q8K3G5 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Vrk3Q8K3G5 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vrk3Q8K3G5 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vrk3Q8K3G5 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vrk3Q8K3G5 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vrk3Q8K3G5 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vrk3Q8K3G5 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vrk3Q8K3G5 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vrk3Q8K3G5 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vrk3Q8K3G5 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vrk3Q8K3G5 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vrk3Q8K3G5 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vrk3Q8K3G5 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vrk3Q8K3G5 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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