Protein–RNA interactions for Protein: Q8K119

Pms1, PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, mousemouse

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Length 917 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pms1Q8K119 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pms1Q8K119 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pms1Q8K119 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pms1Q8K119 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pms1Q8K119 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pms1Q8K119 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pms1Q8K119 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pms1Q8K119 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pms1Q8K119 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pms1Q8K119 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pms1Q8K119 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pms1Q8K119 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pms1Q8K119 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pms1Q8K119 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pms1Q8K119 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pms1Q8K119 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pms1Q8K119 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pms1Q8K119 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pms1Q8K119 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pms1Q8K119 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pms1Q8K119 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pms1Q8K119 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pms1Q8K119 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pms1Q8K119 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pms1Q8K119 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pms1Q8K119 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Pms1Q8K119 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pms1Q8K119 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pms1Q8K119 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pms1Q8K119 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pms1Q8K119 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pms1Q8K119 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pms1Q8K119 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pms1Q8K119 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pms1Q8K119 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pms1Q8K119 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pms1Q8K119 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pms1Q8K119 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pms1Q8K119 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pms1Q8K119 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pms1Q8K119 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pms1Q8K119 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pms1Q8K119 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Pms1Q8K119 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pms1Q8K119 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pms1Q8K119 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pms1Q8K119 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pms1Q8K119 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pms1Q8K119 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pms1Q8K119 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pms1Q8K119 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Pms1Q8K119 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pms1Q8K119 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Pms1Q8K119 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pms1Q8K119 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pms1Q8K119 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Pms1Q8K119 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pms1Q8K119 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pms1Q8K119 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pms1Q8K119 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pms1Q8K119 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pms1Q8K119 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pms1Q8K119 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pms1Q8K119 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pms1Q8K119 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pms1Q8K119 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pms1Q8K119 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pms1Q8K119 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pms1Q8K119 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
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Pms1Q8K119 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pms1Q8K119 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pms1Q8K119 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pms1Q8K119 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pms1Q8K119 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pms1Q8K119 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pms1Q8K119 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pms1Q8K119 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pms1Q8K119 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pms1Q8K119 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pms1Q8K119 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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