Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZR6

Slc4a8, Electroneutral sodium bicarbonate exchanger 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc4a8Q8JZR6 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc4a8Q8JZR6 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc4a8Q8JZR6 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc4a8Q8JZR6 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc4a8Q8JZR6 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc4a8Q8JZR6 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc4a8Q8JZR6 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc4a8Q8JZR6 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc4a8Q8JZR6 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc4a8Q8JZR6 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc4a8Q8JZR6 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc4a8Q8JZR6 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc4a8Q8JZR6 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc4a8Q8JZR6 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc4a8Q8JZR6 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc4a8Q8JZR6 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc4a8Q8JZR6 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc4a8Q8JZR6 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc4a8Q8JZR6 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc4a8Q8JZR6 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc4a8Q8JZR6 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc4a8Q8JZR6 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Slc4a8Q8JZR6 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Slc4a8Q8JZR6 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc4a8Q8JZR6 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc4a8Q8JZR6 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc4a8Q8JZR6 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Slc4a8Q8JZR6 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Slc4a8Q8JZR6 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc4a8Q8JZR6 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Slc4a8Q8JZR6 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Slc4a8Q8JZR6 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Slc4a8Q8JZR6 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc4a8Q8JZR6 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Slc4a8Q8JZR6 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc4a8Q8JZR6 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Slc4a8Q8JZR6 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Slc4a8Q8JZR6 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Slc4a8Q8JZR6 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc4a8Q8JZR6 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc4a8Q8JZR6 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Slc4a8Q8JZR6 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Slc4a8Q8JZR6 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc4a8Q8JZR6 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc4a8Q8JZR6 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc4a8Q8JZR6 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc4a8Q8JZR6 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Slc4a8Q8JZR6 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc4a8Q8JZR6 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc4a8Q8JZR6 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc4a8Q8JZR6 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc4a8Q8JZR6 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc4a8Q8JZR6 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc4a8Q8JZR6 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc4a8Q8JZR6 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc4a8Q8JZR6 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc4a8Q8JZR6 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc4a8Q8JZR6 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc4a8Q8JZR6 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc4a8Q8JZR6 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc4a8Q8JZR6 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc4a8Q8JZR6 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc4a8Q8JZR6 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc4a8Q8JZR6 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Slc4a8Q8JZR6 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Slc4a8Q8JZR6 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc4a8Q8JZR6 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc4a8Q8JZR6 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc4a8Q8JZR6 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc4a8Q8JZR6 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc4a8Q8JZR6 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc4a8Q8JZR6 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc4a8Q8JZR6 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Slc4a8Q8JZR6 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc4a8Q8JZR6 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc4a8Q8JZR6 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc4a8Q8JZR6 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc4a8Q8JZR6 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc4a8Q8JZR6 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Slc4a8Q8JZR6 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc4a8Q8JZR6 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc4a8Q8JZR6 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc4a8Q8JZR6 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc4a8Q8JZR6 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc4a8Q8JZR6 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc4a8Q8JZR6 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc4a8Q8JZR6 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc4a8Q8JZR6 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc4a8Q8JZR6 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Slc4a8Q8JZR6 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc4a8Q8JZR6 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc4a8Q8JZR6 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc4a8Q8JZR6 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc4a8Q8JZR6 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc4a8Q8JZR6 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc4a8Q8JZR6 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc4a8Q8JZR6 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Slc4a8Q8JZR6 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Slc4a8Q8JZR6 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Slc4a8Q8JZR6 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.2 ms