Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ78

Znf628, Zinc finger protein 628, mousemouse

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Length 1,038 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf628Q8CJ78 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Znf628Q8CJ78 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Znf628Q8CJ78 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Znf628Q8CJ78 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Znf628Q8CJ78 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Znf628Q8CJ78 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Znf628Q8CJ78 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Znf628Q8CJ78 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Znf628Q8CJ78 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Znf628Q8CJ78 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Znf628Q8CJ78 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Znf628Q8CJ78 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Znf628Q8CJ78 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Znf628Q8CJ78 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Znf628Q8CJ78 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Znf628Q8CJ78 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Znf628Q8CJ78 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Znf628Q8CJ78 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Znf628Q8CJ78 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Znf628Q8CJ78 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Znf628Q8CJ78 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Znf628Q8CJ78 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Znf628Q8CJ78 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Znf628Q8CJ78 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Znf628Q8CJ78 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Znf628Q8CJ78 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Znf628Q8CJ78 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Znf628Q8CJ78 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Znf628Q8CJ78 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Znf628Q8CJ78 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Znf628Q8CJ78 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Znf628Q8CJ78 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Znf628Q8CJ78 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Znf628Q8CJ78 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Znf628Q8CJ78 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Znf628Q8CJ78 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Znf628Q8CJ78 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Znf628Q8CJ78 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Znf628Q8CJ78 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Znf628Q8CJ78 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Znf628Q8CJ78 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Znf628Q8CJ78 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Znf628Q8CJ78 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Znf628Q8CJ78 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Znf628Q8CJ78 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Znf628Q8CJ78 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Znf628Q8CJ78 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Znf628Q8CJ78 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Znf628Q8CJ78 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Znf628Q8CJ78 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Znf628Q8CJ78 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Znf628Q8CJ78 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Znf628Q8CJ78 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Znf628Q8CJ78 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Znf628Q8CJ78 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Znf628Q8CJ78 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Znf628Q8CJ78 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Znf628Q8CJ78 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Znf628Q8CJ78 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Znf628Q8CJ78 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Znf628Q8CJ78 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Znf628Q8CJ78 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Znf628Q8CJ78 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Znf628Q8CJ78 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Znf628Q8CJ78 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Znf628Q8CJ78 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Znf628Q8CJ78 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Znf628Q8CJ78 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Znf628Q8CJ78 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf628Q8CJ78 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf628Q8CJ78 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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