Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIT9

Sbsn, Suprabasin, mousemouse

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Length 700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsnQ8CIT9 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
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SbsnQ8CIT9 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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SbsnQ8CIT9 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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SbsnQ8CIT9 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
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SbsnQ8CIT9 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
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SbsnQ8CIT9 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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SbsnQ8CIT9 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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SbsnQ8CIT9 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
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SbsnQ8CIT9 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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SbsnQ8CIT9 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
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SbsnQ8CIT9 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms