Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFK2

Brf1, Transcription factor IIIB 90 kDa subunit, mousemouse

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Length 676 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brf1Q8CFK2 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Brf1Q8CFK2 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brf1Q8CFK2 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Brf1Q8CFK2 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brf1Q8CFK2 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brf1Q8CFK2 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Brf1Q8CFK2 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brf1Q8CFK2 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brf1Q8CFK2 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brf1Q8CFK2 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brf1Q8CFK2 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brf1Q8CFK2 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brf1Q8CFK2 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brf1Q8CFK2 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brf1Q8CFK2 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Brf1Q8CFK2 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brf1Q8CFK2 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brf1Q8CFK2 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brf1Q8CFK2 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brf1Q8CFK2 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brf1Q8CFK2 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brf1Q8CFK2 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Brf1Q8CFK2 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brf1Q8CFK2 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brf1Q8CFK2 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brf1Q8CFK2 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brf1Q8CFK2 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brf1Q8CFK2 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brf1Q8CFK2 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brf1Q8CFK2 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brf1Q8CFK2 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brf1Q8CFK2 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brf1Q8CFK2 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brf1Q8CFK2 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brf1Q8CFK2 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Brf1Q8CFK2 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brf1Q8CFK2 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brf1Q8CFK2 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brf1Q8CFK2 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Brf1Q8CFK2 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brf1Q8CFK2 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brf1Q8CFK2 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Brf1Q8CFK2 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brf1Q8CFK2 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Brf1Q8CFK2 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brf1Q8CFK2 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brf1Q8CFK2 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Brf1Q8CFK2 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brf1Q8CFK2 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brf1Q8CFK2 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brf1Q8CFK2 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brf1Q8CFK2 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brf1Q8CFK2 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brf1Q8CFK2 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brf1Q8CFK2 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Brf1Q8CFK2 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brf1Q8CFK2 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brf1Q8CFK2 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brf1Q8CFK2 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Brf1Q8CFK2 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Brf1Q8CFK2 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brf1Q8CFK2 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brf1Q8CFK2 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brf1Q8CFK2 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brf1Q8CFK2 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brf1Q8CFK2 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brf1Q8CFK2 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brf1Q8CFK2 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brf1Q8CFK2 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brf1Q8CFK2 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Brf1Q8CFK2 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Brf1Q8CFK2 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Brf1Q8CFK2 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Brf1Q8CFK2 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Brf1Q8CFK2 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Brf1Q8CFK2 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Brf1Q8CFK2 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Brf1Q8CFK2 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Brf1Q8CFK2 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Brf1Q8CFK2 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Brf1Q8CFK2 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Brf1Q8CFK2 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Brf1Q8CFK2 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Brf1Q8CFK2 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Brf1Q8CFK2 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Brf1Q8CFK2 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Brf1Q8CFK2 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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