Protein–RNA interactions for Protein: Q8CC27

Cacnb2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb2Q8CC27 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cacnb2Q8CC27 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cacnb2Q8CC27 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cacnb2Q8CC27 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cacnb2Q8CC27 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cacnb2Q8CC27 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cacnb2Q8CC27 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cacnb2Q8CC27 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Cacnb2Q8CC27 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cacnb2Q8CC27 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Cacnb2Q8CC27 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cacnb2Q8CC27 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cacnb2Q8CC27 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cacnb2Q8CC27 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cacnb2Q8CC27 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cacnb2Q8CC27 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cacnb2Q8CC27 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Cacnb2Q8CC27 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Cacnb2Q8CC27 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cacnb2Q8CC27 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cacnb2Q8CC27 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Cacnb2Q8CC27 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Cacnb2Q8CC27 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Cacnb2Q8CC27 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cacnb2Q8CC27 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Cacnb2Q8CC27 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Cacnb2Q8CC27 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cacnb2Q8CC27 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cacnb2Q8CC27 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Cacnb2Q8CC27 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cacnb2Q8CC27 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cacnb2Q8CC27 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cacnb2Q8CC27 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cacnb2Q8CC27 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cacnb2Q8CC27 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cacnb2Q8CC27 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cacnb2Q8CC27 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cacnb2Q8CC27 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cacnb2Q8CC27 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cacnb2Q8CC27 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cacnb2Q8CC27 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cacnb2Q8CC27 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Cacnb2Q8CC27 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cacnb2Q8CC27 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cacnb2Q8CC27 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cacnb2Q8CC27 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cacnb2Q8CC27 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cacnb2Q8CC27 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cacnb2Q8CC27 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cacnb2Q8CC27 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cacnb2Q8CC27 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cacnb2Q8CC27 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cacnb2Q8CC27 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cacnb2Q8CC27 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cacnb2Q8CC27 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cacnb2Q8CC27 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cacnb2Q8CC27 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cacnb2Q8CC27 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cacnb2Q8CC27 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cacnb2Q8CC27 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cacnb2Q8CC27 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cacnb2Q8CC27 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cacnb2Q8CC27 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cacnb2Q8CC27 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Cacnb2Q8CC27 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cacnb2Q8CC27 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cacnb2Q8CC27 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cacnb2Q8CC27 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Cacnb2Q8CC27 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cacnb2Q8CC27 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Cacnb2Q8CC27 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cacnb2Q8CC27 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cacnb2Q8CC27 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cacnb2Q8CC27 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cacnb2Q8CC27 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cacnb2Q8CC27 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cacnb2Q8CC27 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Cacnb2Q8CC27 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cacnb2Q8CC27 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cacnb2Q8CC27 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cacnb2Q8CC27 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cacnb2Q8CC27 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cacnb2Q8CC27 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cacnb2Q8CC27 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cacnb2Q8CC27 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cacnb2Q8CC27 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Cacnb2Q8CC27 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cacnb2Q8CC27 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cacnb2Q8CC27 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cacnb2Q8CC27 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cacnb2Q8CC27 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cacnb2Q8CC27 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cacnb2Q8CC27 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cacnb2Q8CC27 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cacnb2Q8CC27 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cacnb2Q8CC27 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cacnb2Q8CC27 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cacnb2Q8CC27 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cacnb2Q8CC27 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cacnb2Q8CC27 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms