Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAT8

Fbxo48, F-box only protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo48Q8CAT8 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Fbxo48Q8CAT8 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Fbxo48Q8CAT8 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Fbxo48Q8CAT8 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Fbxo48Q8CAT8 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Fbxo48Q8CAT8 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Fbxo48Q8CAT8 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Fbxo48Q8CAT8 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Fbxo48Q8CAT8 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Fbxo48Q8CAT8 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Fbxo48Q8CAT8 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Fbxo48Q8CAT8 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Fbxo48Q8CAT8 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Fbxo48Q8CAT8 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Fbxo48Q8CAT8 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Fbxo48Q8CAT8 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Fbxo48Q8CAT8 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Fbxo48Q8CAT8 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Fbxo48Q8CAT8 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Fbxo48Q8CAT8 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Fbxo48Q8CAT8 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Fbxo48Q8CAT8 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Fbxo48Q8CAT8 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Fbxo48Q8CAT8 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Fbxo48Q8CAT8 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Fbxo48Q8CAT8 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fbxo48Q8CAT8 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fbxo48Q8CAT8 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fbxo48Q8CAT8 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fbxo48Q8CAT8 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fbxo48Q8CAT8 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fbxo48Q8CAT8 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fbxo48Q8CAT8 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fbxo48Q8CAT8 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fbxo48Q8CAT8 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fbxo48Q8CAT8 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fbxo48Q8CAT8 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fbxo48Q8CAT8 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fbxo48Q8CAT8 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fbxo48Q8CAT8 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fbxo48Q8CAT8 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Fbxo48Q8CAT8 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fbxo48Q8CAT8 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Fbxo48Q8CAT8 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fbxo48Q8CAT8 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fbxo48Q8CAT8 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fbxo48Q8CAT8 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fbxo48Q8CAT8 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fbxo48Q8CAT8 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fbxo48Q8CAT8 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Fbxo48Q8CAT8 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fbxo48Q8CAT8 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fbxo48Q8CAT8 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fbxo48Q8CAT8 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fbxo48Q8CAT8 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fbxo48Q8CAT8 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fbxo48Q8CAT8 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fbxo48Q8CAT8 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fbxo48Q8CAT8 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fbxo48Q8CAT8 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fbxo48Q8CAT8 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fbxo48Q8CAT8 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fbxo48Q8CAT8 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fbxo48Q8CAT8 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fbxo48Q8CAT8 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fbxo48Q8CAT8 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fbxo48Q8CAT8 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fbxo48Q8CAT8 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Fbxo48Q8CAT8 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Fbxo48Q8CAT8 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fbxo48Q8CAT8 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fbxo48Q8CAT8 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fbxo48Q8CAT8 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fbxo48Q8CAT8 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fbxo48Q8CAT8 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fbxo48Q8CAT8 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fbxo48Q8CAT8 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fbxo48Q8CAT8 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fbxo48Q8CAT8 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fbxo48Q8CAT8 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fbxo48Q8CAT8 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fbxo48Q8CAT8 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Fbxo48Q8CAT8 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fbxo48Q8CAT8 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fbxo48Q8CAT8 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fbxo48Q8CAT8 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fbxo48Q8CAT8 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Fbxo48Q8CAT8 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fbxo48Q8CAT8 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Fbxo48Q8CAT8 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Fbxo48Q8CAT8 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fbxo48Q8CAT8 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fbxo48Q8CAT8 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fbxo48Q8CAT8 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Fbxo48Q8CAT8 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fbxo48Q8CAT8 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fbxo48Q8CAT8 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fbxo48Q8CAT8 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fbxo48Q8CAT8 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fbxo48Q8CAT8 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms