Protein–RNA interactions for Protein: Q8C708

Transmembrane protein C16orf54 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8C708 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q8C708 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q8C708 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q8C708 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q8C708 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q8C708 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q8C708 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q8C708 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q8C708 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Q8C708 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q8C708 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q8C708 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q8C708 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q8C708 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q8C708 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q8C708 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q8C708 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q8C708 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q8C708 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q8C708 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q8C708 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q8C708 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q8C708 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q8C708 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Q8C708 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q8C708 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q8C708 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q8C708 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q8C708 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q8C708 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q8C708 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q8C708 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q8C708 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q8C708 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q8C708 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q8C708 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q8C708 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q8C708 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q8C708 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q8C708 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Q8C708 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q8C708 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q8C708 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q8C708 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q8C708 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q8C708 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q8C708 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q8C708 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q8C708 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Q8C708 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q8C708 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q8C708 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q8C708 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q8C708 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q8C708 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q8C708 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q8C708 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q8C708 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q8C708 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q8C708 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q8C708 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q8C708 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q8C708 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q8C708 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q8C708 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q8C708 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q8C708 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q8C708 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q8C708 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q8C708 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q8C708 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q8C708 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q8C708 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q8C708 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q8C708 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q8C708 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q8C708 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q8C708 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q8C708 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q8C708 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q8C708 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q8C708 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q8C708 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q8C708 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q8C708 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q8C708 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q8C708 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q8C708 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q8C708 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q8C708 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q8C708 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q8C708 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Q8C708 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Q8C708 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Q8C708 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q8C708 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q8C708 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q8C708 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Q8C708 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Q8C708 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms