Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6M1

Usp20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp20Q8C6M1 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.7 ms