Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5V8

Ccdc187, Coiled-coil domain-containing protein 187, mousemouse

Predictions only

Length 958 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc187Q8C5V8 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc187Q8C5V8 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc187Q8C5V8 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc187Q8C5V8 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc187Q8C5V8 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc187Q8C5V8 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc187Q8C5V8 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc187Q8C5V8 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc187Q8C5V8 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc187Q8C5V8 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc187Q8C5V8 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc187Q8C5V8 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc187Q8C5V8 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc187Q8C5V8 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc187Q8C5V8 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc187Q8C5V8 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc187Q8C5V8 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc187Q8C5V8 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc187Q8C5V8 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc187Q8C5V8 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc187Q8C5V8 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc187Q8C5V8 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc187Q8C5V8 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc187Q8C5V8 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc187Q8C5V8 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc187Q8C5V8 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc187Q8C5V8 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc187Q8C5V8 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc187Q8C5V8 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc187Q8C5V8 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc187Q8C5V8 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc187Q8C5V8 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc187Q8C5V8 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc187Q8C5V8 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc187Q8C5V8 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc187Q8C5V8 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc187Q8C5V8 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc187Q8C5V8 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc187Q8C5V8 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc187Q8C5V8 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc187Q8C5V8 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc187Q8C5V8 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc187Q8C5V8 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc187Q8C5V8 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc187Q8C5V8 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc187Q8C5V8 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc187Q8C5V8 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc187Q8C5V8 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ccdc187Q8C5V8 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ccdc187Q8C5V8 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ccdc187Q8C5V8 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ccdc187Q8C5V8 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ccdc187Q8C5V8 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ccdc187Q8C5V8 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ccdc187Q8C5V8 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
Ccdc187Q8C5V8 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ccdc187Q8C5V8 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc187Q8C5V8 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc187Q8C5V8 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc187Q8C5V8 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc187Q8C5V8 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc187Q8C5V8 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc187Q8C5V8 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc187Q8C5V8 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc187Q8C5V8 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc187Q8C5V8 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc187Q8C5V8 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc187Q8C5V8 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc187Q8C5V8 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc187Q8C5V8 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc187Q8C5V8 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc187Q8C5V8 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc187Q8C5V8 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc187Q8C5V8 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc187Q8C5V8 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc187Q8C5V8 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc187Q8C5V8 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc187Q8C5V8 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc187Q8C5V8 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc187Q8C5V8 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc187Q8C5V8 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc187Q8C5V8 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc187Q8C5V8 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc187Q8C5V8 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc187Q8C5V8 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc187Q8C5V8 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc187Q8C5V8 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc187Q8C5V8 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc187Q8C5V8 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc187Q8C5V8 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc187Q8C5V8 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc187Q8C5V8 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc187Q8C5V8 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc187Q8C5V8 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc187Q8C5V8 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc187Q8C5V8 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc187Q8C5V8 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc187Q8C5V8 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc187Q8C5V8 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc187Q8C5V8 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms