Protein–RNA interactions for Protein: Q8BY87

Usp47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, mousemouse

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Length 1,376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Usp47Q8BY87 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
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Usp47Q8BY87 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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Usp47Q8BY87 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp47Q8BY87 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
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Usp47Q8BY87 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp47Q8BY87 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
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Usp47Q8BY87 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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