Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pggt1bQ8BUY9 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pggt1bQ8BUY9 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Pggt1bQ8BUY9 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pggt1bQ8BUY9 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pggt1bQ8BUY9 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pggt1bQ8BUY9 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pggt1bQ8BUY9 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pggt1bQ8BUY9 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pggt1bQ8BUY9 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pggt1bQ8BUY9 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pggt1bQ8BUY9 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pggt1bQ8BUY9 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Pggt1bQ8BUY9 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pggt1bQ8BUY9 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pggt1bQ8BUY9 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Pggt1bQ8BUY9 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Pggt1bQ8BUY9 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pggt1bQ8BUY9 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pggt1bQ8BUY9 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pggt1bQ8BUY9 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pggt1bQ8BUY9 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pggt1bQ8BUY9 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pggt1bQ8BUY9 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pggt1bQ8BUY9 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pggt1bQ8BUY9 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pggt1bQ8BUY9 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pggt1bQ8BUY9 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pggt1bQ8BUY9 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pggt1bQ8BUY9 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pggt1bQ8BUY9 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pggt1bQ8BUY9 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pggt1bQ8BUY9 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pggt1bQ8BUY9 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pggt1bQ8BUY9 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pggt1bQ8BUY9 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pggt1bQ8BUY9 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pggt1bQ8BUY9 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pggt1bQ8BUY9 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pggt1bQ8BUY9 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pggt1bQ8BUY9 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pggt1bQ8BUY9 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pggt1bQ8BUY9 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pggt1bQ8BUY9 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pggt1bQ8BUY9 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pggt1bQ8BUY9 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pggt1bQ8BUY9 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pggt1bQ8BUY9 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pggt1bQ8BUY9 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pggt1bQ8BUY9 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pggt1bQ8BUY9 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pggt1bQ8BUY9 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pggt1bQ8BUY9 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pggt1bQ8BUY9 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pggt1bQ8BUY9 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pggt1bQ8BUY9 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pggt1bQ8BUY9 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pggt1bQ8BUY9 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pggt1bQ8BUY9 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pggt1bQ8BUY9 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pggt1bQ8BUY9 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Pggt1bQ8BUY9 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pggt1bQ8BUY9 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pggt1bQ8BUY9 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Pggt1bQ8BUY9 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Pggt1bQ8BUY9 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pggt1bQ8BUY9 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pggt1bQ8BUY9 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pggt1bQ8BUY9 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Pggt1bQ8BUY9 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pggt1bQ8BUY9 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pggt1bQ8BUY9 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pggt1bQ8BUY9 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pggt1bQ8BUY9 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pggt1bQ8BUY9 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pggt1bQ8BUY9 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pggt1bQ8BUY9 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pggt1bQ8BUY9 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pggt1bQ8BUY9 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pggt1bQ8BUY9 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pggt1bQ8BUY9 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pggt1bQ8BUY9 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pggt1bQ8BUY9 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pggt1bQ8BUY9 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pggt1bQ8BUY9 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pggt1bQ8BUY9 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pggt1bQ8BUY9 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pggt1bQ8BUY9 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pggt1bQ8BUY9 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pggt1bQ8BUY9 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Pggt1bQ8BUY9 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pggt1bQ8BUY9 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pggt1bQ8BUY9 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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